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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001441`

染色体: Chr07 坐标: 11172620-11261334 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001441`
名称	SmilChr07G001441
描述	uncharacterized SmilChr07G001441
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11172620 - 11261334 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992619`
GeneID	`130992619`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992619`
原始查询	`SmilChr07G001441`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA-splicing ligase (DUF239) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835754]; symbol=AT5G56530; hit=AT5G56530; species=arabidopsis; confidence=high
产物	tRNA-splicing ligase (DUF239) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835754]; symbol=AT5G56530; hit=AT5G56530; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G56530` (AT5G56530) tRNA-splicing ligase (DUF239) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835754] identity=78.4; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0573400` - identity=80.7; qcov=0.894; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03080 (Neprosin); PF14365 (Neprosin_AP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992619

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057773315.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057773315.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057773315.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773315.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773315.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11173138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:11173216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr7:11173255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr7:11173672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr7:11173695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr7:11173889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr7:11174397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B109,C11,C69,C75
`Chr7:11174486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:11175310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773315.1

423 aa

212

423

Neprosin_AP

Neprosin

PF14365 Neprosin_AP 59-181 aa PF03080 Neprosin 205-416 aa

XP_057773316.1

423 aa

212

423

Neprosin_AP

Neprosin

PF14365 Neprosin_AP 59-181 aa PF03080 Neprosin 205-416 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773315.1`	Pfam	`PF14365`	Neprosin_AP	Family	59	181	1.9e-48	164.6	Neprosin activation peptide
`XP_057773315.1`	Pfam	`PF03080`	Neprosin	Family	205	416	1e-87	293.8	Neprosin
`XP_057773316.1`	Pfam	`PF14365`	Neprosin_AP	Family	59	181	1.9e-48	164.6	Neprosin activation peptide
`XP_057773316.1`	Pfam	`PF03080`	Neprosin	Family	205	416	1e-87	293.8	Neprosin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917333.1
GGAGGAGGGAGAGGGAGGTGAAGCTAAGTAGCTAAACAGTAATACTGGGGGGTTGCATAGATAAGCAAAGTAGTTCCTTTTTTGTGATTTCAATGGTGCGCTTGTATCATTGAATCTCGGGCTCGTGCTAACGTACGCCTCGGGCTTGCAAAATTATTGAATCTTTTCGAGTTTTGCTCACTTGGAGGTTGTTGGAAATTTGCAATGGGTGGTGCCGGGTTTAGCGGTGGCCACCGGGGGAGAAGCGTGAAGGTGGCGGT...

XM_057917332.1
TTGCCCCTCGTGTTCGAAAAGCCTAAATTCTAAAAAAAAAAAAAAGTGTAATAAATTTTTGTACTAAATCATTAAAAATTGCTTGAATAAAAACAGACATCTCTGCAAACATAATTGGCTTTTCTCGAAGCACCGCAAACGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAAGGGAGGAGGGAGGTGAAGCTAAGTAGCTAAACAGTAATACTGGGGGGTTGCATAGATAAGCAAAGTAGTTCCTTTTTTGTGATTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992619
ATGGGTGGTGCCGGGTTTAGCGGTGGCCACCGGGGGAGAAGCGTGAAGGTGGCGGTGTTCTTAGCTTGTTTATGGGGTTTTATGTCTCTATCTTGCGCCGGGAGACTGTCTCCTTCGAGACAGAAGCTTGAAGTTCGGAAGCACCTGAAAAGACTCAATAAACCTGCCGCTAAATCCATTGAGAGCCCAGATGGGGATGTTATTGACTGTGTGCCTATCTCAAACCAACCAGCTTTTGATCACCCTTTTCTCAAAGACCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773315.1
MGGAGFSGGHRGRSVKVAVFLACLWGFMSLSCAGRLSPSRQKLEVRKHLKRLNKPAAKSIESPDGDVIDCVPISNQPAFDHPFLKDHKIQTRPSFHPEGLFGDNKMSSGSKQRANPITQLWHMNGKCSEGTIPIRRTKKEDVLRASSVKRYGKKKHKSIPKPRSADPDFINESGHQHAIAYVEGDKYFGAKATINVWEPKIQQPNEFSLSQVWVLGGSFGEDLNSIEAGWQVSPDLYGDNNTRLFTYWTSDAYQATGCYN...

XP_057773316.1
MGGAGFSGGHRGRSVKVAVFLACLWGFMSLSCAGRLSPSRQKLEVRKHLKRLNKPAAKSIESPDGDVIDCVPISNQPAFDHPFLKDHKIQTRPSFHPEGLFGDNKMSSGSKQRANPITQLWHMNGKCSEGTIPIRRTKKEDVLRASSVKRYGKKKHKSIPKPRSADPDFINESGHQHAIAYVEGDKYFGAKATINVWEPKIQQPNEFSLSQVWVLGGSFGEDLNSIEAGWQVSPDLYGDNNTRLFTYWTSDAYQATGCYN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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