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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001464`

染色体: Chr07 坐标: 11487473-11488224 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001464`
名称	SmilChr07G001464
描述	cysteine proteinase inhibitor 5
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11487473 - 11488224 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992684`
GeneID	`130992684`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992684`
原始查询	`SmilChr07G001464`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine proteinase inhibitor 5
产物	cysteine proteinase inhibitor 5
Arabidopsis	`AT2G31980` (CYS2) PHYTOCYSTATIN 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817757] identity=41.2; qcov=0.963; evalue=1.25e-26; confidence=medium
Rice	`Os04g0350100` - identity=48.7; qcov=0.86; evalue=1.51e-28; confidence=medium
GO	GO:0004869 (cysteine-type endopeptidase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	PF00031 (Cystatin); PF16845 (SQAPI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992684

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057773418.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773418.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773418.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773418.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773418.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11487657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B137,B2,C61
`Chr7:11487725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C30
`Chr7:11487734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A21,A6,B82,C78
`Chr7:11487737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C40
`Chr7:11487778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C40
`Chr7:11487789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:11487834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr7:11487844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr7:11487850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,D6
`Chr7:11487855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B83,C12,C52
`Chr7:11487873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr7:11487929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B47,B83,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773418.1

136 aa

136

Cystatin

SQAPI

PF00031 Cystatin 39-119 aa PF16845 SQAPI 40-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773418.1`	Pfam	`PF00031`	Cystatin	Domain	39	119	3e-09	37.7	Cystatin domain
`XP_057773418.1`	Pfam	`PF16845`	SQAPI	Domain	40	126	1.4e-17	64.5	Aspartic acid proteinase inhibitor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917435.1
ACAGCCCACTCCGAGACAACAGTACAAAAAGAGTGCATACTTCTATCTATCCTCTGCCCTCTGCATTACAAAAACGCGGCACCCCGCTGCTGCTGCCACCCCCTTCCTTACGTGTCCTCACTCCAATTAATCTCTCTTCATATATATCATCTTCATCGATCCTACCCAAACACACACACTGAAAACACATATGGCCAAATCAAGATTCCCTTCTCCGCTGCTGCTGCTGCTCCTCCTGCTCCTGGCCGCCGCATTCCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992684
ATGGCCAAATCAAGATTCCCTTCTCCGCTGCTGCTGCTGCTCCTCCTGCTCCTGGCCGCCGCATTCCCTCGAGACGCGGCGGCGGTGGGCAGAAAAGTGGGAGGGCGAATGCAGGTGAAGAACGTGAAGGACAACAAGGAAGTGCAAGAGCTGGGCAGATACTGCGTGGGTGAATACAACCGGCGCAAGGCTAACGAAGGCAGCGAGAAGCTTCTGGTGTTCTCGCAGGTGGTGGAGGCGCAGACGCAGGTGGTCTCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773418.1
MAKSRFPSPLLLLLLLLLAAAFPRDAAAVGRKVGGRMQVKNVKDNKEVQELGRYCVGEYNRRKANEGSEKLLVFSQVVEAQTQVVSGIKYYLKVLAAKPLAGAPETFEAVVVVKPWLQSKDLIQFTPSQPPTTSTK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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