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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001476`

染色体: Chr07 坐标: 11601920-11605661 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001476`
名称	SmilChr07G001476
描述	protein TIC 22-like, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11601920 - 11605661 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992653`
GeneID	`130992653`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992653`
原始查询	`SmilChr07G001476`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIC 22-like, chloroplastic
产物	protein TIC 22-like%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G23710` (Tic22-III) Tic22-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821952] identity=60.8; qcov=0.832; evalue=2.04e-97; confidence=high
Rice	`Os07g0290800` (P0656C04.101) - identity=54.8; qcov=0.73; evalue=5.23e-65; confidence=high
GO	GO:0009507 (chloroplast); GO:0015031 (protein transport)
KEGG	-
Pfam	PF04278 (Tic22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992653

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057773373.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057773373.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057773373.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057773373.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773373.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11602770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr7:11604224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B137
`Chr7:11604226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C74
`Chr7:11604227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B137
`Chr7:11604701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C71
`Chr7:11605127`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A21,A5,B104,B105,B139,B35,B41,B66,B98,C20
`Chr7:11605129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,A5,B105,B35,C20
`Chr7:11605130`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B59,C75
`Chr7:11605130`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B59,C75
`Chr7:11605159`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	23	A21,A5,B104,B105,B139,B3,B35,B41,B54,B59,B66,B69,B93,B97,B98,C19,C20,C24,C53,C64,C75,C87,D3
`Chr7:11605206`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A21,B123,B66,B91,D6
`Chr7:11605206`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A21,B123,B66,B91,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773373.1

285 aa

142

285

Tic22

PF04278 Tic22 25-279 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773373.1`	Pfam	`PF04278`	Tic22	Family	25	279	9.4e-83	278.0	Tic22-like family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917390.1
GAGCAACAATACCCCATTTTCCATTTTCTTTGTAGCACAACAATTTCTTCTTCAACTTAAGCTATCTCAAAAACCCATGAATTTCTTTAAACCCAAAGACACCCGGCAGCCGGCGGCGCCACCGCCGTCGCCTCAGCTTCTCCTCCACCGAGCCGTCACATCTCTCCAGACCCACTTCTCAACCATCTTGAACAATTTGCAGACCAACCCTCCTCTCAGAAACCCTTTCTTTGCCAGAATTTCCGACGAAAACAACACGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992653
ATGAATTTCTTTAAACCCAAAGACACCCGGCAGCCGGCGGCGCCACCGCCGTCGCCTCAGCTTCTCCTCCACCGAGCCGTCACATCTCTCCAGACCCACTTCTCAACCATCTTGAACAATTTGCAGACCAACCCTCCTCTCAGAAACCCTTTCTTTGCCAGAATTTCCGACGAAAACAACACGGTTCAGAGCAAAGTCAGTCCCACTAATAGCAGTAGTAATCTAACTGCTAAGAATTGCGCCATGTCGCCGGAGGCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773373.1
MNFFKPKDTRQPAAPPPSPQLLLHRAVTSLQTHFSTILNNLQTNPPLRNPFFARISDENNTVQSKVSPTNSSSNLTAKNCAMSPEAIEERLAGVPVYALSNGAEEFVLVSGAQSRRDLGLFFFTEADAEALLKHMKSVDSSMSSGSQVVPVALSKVFDLKVNGVALRLLPEASQIKNALQERKRVGLEDESFRGVPVFQSKSLVLRSQNKTYRPVFFRKEDLEKSLSRASRDQKQANPSLRRGDVQVAVLEDIIRGMKDT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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