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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001483`

染色体: Chr07 坐标: 11673271-11674896 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001483`
名称	SmilChr07G001483
描述	28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11673271 - 11674896 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992655`
GeneID	`130992655`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992655`
原始查询	`SmilChr07G001483`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic
产物	28 kDa ribonucleoprotein%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G09040` (AT4G09040) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826483] identity=58.7; qcov=0.681; evalue=1.38e-69; confidence=high
Rice	`Os08g0483200` (OJ1111_H02.19-1) - identity=44.5; qcov=0.741; evalue=7.19e-52; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992655

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057773375.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057773375.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773375.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773375.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773375.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11673477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,C43
`Chr7:11673556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:11673623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:11673644`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B126
`Chr7:11673644`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B126
`Chr7:11673662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B101,C87
`Chr7:11673689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B69
`Chr7:11674097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B84
`Chr7:11674551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:11674594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr7:11674652`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B91,C19,C20,C31
`Chr7:11674652`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B91,C19,C20,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773375.1

270 aa

135

270

RRM_1

PF00076 RRM_1 70-139 aa PF00076 RRM_1 163-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773375.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	70	139	7.7e-31	106.5	RNA recognition motif
`XP_057773375.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	163	234	7.7e-31	106.5	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917392.1
CAATATCTCCTCAAGTAAGGGATAAAACTGCAATTCCGCCGCATAAACATATGACTCATGAGTATTCCTTCTCTTATCCTTCCCCTCCCTCACTCCCTCTCTCACACATGTTCATCAATATTAGCTGGAGCAATATTTGCAAACTGCTATAAATGGCCGCCGCATTTCGAATTCTGTATTTCCCTCCCGCCACCTCCCACACCCACCTGCCGCTACCCAACCACCGTCTTCTTCTATCCGTCGGCAGCAGGCCTCGGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992655
ATGGCCGCCGCATTTCGAATTCTGTATTTCCCTCCCGCCACCTCCCACACCCACCTGCCGCTACCCAACCACCGTCTTCTTCTATCCGTCGGCAGCAGGCCTCGGAAGTCCAATTTACACCTGTTCCTCAACGCCCCACTCCGAGCCCTTCCAGCTATTCAATCACAAATTACCGCCGAATCAGAAGATGAAGTTTCTACGACGAGGTTGCTCGTCCAGAATGTTCCATGGACATCCACCGAGGATGATCTTCGCCCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773375.1
MAAAFRILYFPPATSHTHLPLPNHRLLLSVGSRPRKSNLHLFLNAPLRALPAIQSQITAESEDEVSTTRLLVQNVPWTSTEDDLRPLFQKYGTVVEIEFSMYNKERNRGLAFVTMGSPDEALAAFNSLEASEFEGRVLKLNWAKPKKPKQPPSPPRPKAVHNLFVTFLPFQARSKDLKEFFNAHNANAVSAEIIFRDNPRRSAGYGFVSFNTKAEADAALAAFQGKEFMGRTLRVAPSKRFLRQETAATIQSASESESGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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