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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001488`

染色体: Chr07 坐标: 11711917-11715246 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001488`
名称	SmilChr07G001488
描述	cytochrome c oxidase subunit 6b-1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11711917 - 11715246 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992679`
GeneID	`130992679`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992679`
原始查询	`SmilChr07G001488`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome c oxidase subunit 6b-1-like
产物	cytochrome c oxidase subunit 6b-1-like
Arabidopsis	`AT1G22450` (COX6B) cytochrome C oxidase 6B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838851] identity=54.9; qcov=1.02; evalue=8.9e-58; confidence=high
Rice	`Os03g0390400` (OsCOX6b1) - identity=53.3; qcov=1.03; evalue=4.9e-56; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0045277 (respiratory chain complex IV)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02297 (COX6B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992679

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057773412.1`
2	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.60000	`XP_057773412.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057773412.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057773412.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773412.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11713157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773412.1

189 aa

189

COX6B

PF02297 COX6B 126-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773412.1`	Pfam	`PF02297`	COX6B	Domain	126	186	1.6e-21	76.9	Cytochrome oxidase c subunit VIb

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917429.1
CTATAATTAAATGAGAGAGGCAGTGTCTGTCACTTCCTTTGTCGTCTCTTCTCACTGCAATCTCACAGCCGTTGTCACTTGTCATCCCTTCCGTTCCTCCTCCAATGGCCGACGTTGACACCTCCAAGCTCCCATCTTTGGCTGAGGACTATTTACTGGTTGAGAAAGACCAAAAGCCAGTCATGGCTGAAAAATCTGTAGTCAAACCCTCGGAAAATACTACTGCTGAGGAACCCGTTCATAAGGAAATGCCTAGTGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992679
ATGGCCGACGTTGACACCTCCAAGCTCCCATCTTTGGCTGAGGACTATTTACTGGTTGAGAAAGACCAAAAGCCAGTCATGGCTGAAAAATCTGTAGTCAAACCCTCGGAAAATACTACTGCTGAGGAACCCGTTCATAAGGAAATGCCTAGTGCTGTTGAAAATGAAGCTGCTCCTATTGCTGGAGTGGGTGTTGAAGCCACAAATGATGCTAGTGGAGAAAGTACGGAATCCAGTCCTGTTGATGACACTGCCGACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773412.1
MADVDTSKLPSLAEDYLLVEKDQKPVMAEKSVVKPSENTTAEEPVHKEMPSAVENEAAPIAGVGVEATNDASGESTESSPVDDTADSANSASSEESSESAESGDTVDQEADETPEIKLETAPADFRFPTTNQTRHCFTRYIEYHRCVAAKGEEAPECDKFAKYYRSLCPGEWVDRWNEQRENGTFPGPL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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