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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001491`

染色体: Chr07 坐标: 11755156-11778423 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001491`
名称	SmilChr07G001491
描述	rho GTPase-activating protein REN1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11755156 - 11778423 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993818`
GeneID	`130993818`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993818`
原始查询	`SmilChr07G001491`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rho GTPase-activating protein REN1
产物	rho GTPase-activating protein REN1
Arabidopsis	`AT4G24580` (REN1) Rho GTPase activation protein (RhoGAP) with PH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828560] identity=52.9; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0658300` (Spin6.2) - identity=48.1; qcov=0.942; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF00169 (PH); PF00620 (RhoGAP); PF14389 (Lzipper-MIP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993818

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057774839.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057774839.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774839.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774839.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774839.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11755384`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B66
`Chr7:11755384`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B66
`Chr7:11755495`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	73	A1,A16,A18,A19,A22,A25,B1,B10,B108,B11,B110,B113,B114,B118,B120,B121,B123,B127,B129,B137,B138,B21,B23,B25,B27,B30,B31,B44,B47,B49,B51,B59,B60,B64,B65,B66,B71,B73,B77,B79,B88,B9,B93,B94,B97,B99,C1,C15,C18,C23,C24,C25,C26,C34,C36,C37,C42,C57,C59,C6,C63,C64,C66,C79,C80,C81,C83,C87,C9,D10,D6,D7,D8
`Chr7:11755547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B61,C77
`Chr7:11756559`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	73	A1,A14,A19,A20,A21,A22,A6,A8,B104,B107,B108,B109,B11,B123,B124,B130,B132,B133,B134,B136,B138,B139,B140,B17,B22,B28,B31,B35,B38,B39,B41,B47,B5,B50,B51,B57,B6,B63,B64,B66,B70,B76,B83,B89,C12,C13,C24,C25,C30,C34,C37,C43,C44,C5,C50,C51,C53,C54,C56,C57,C58,C59,C60,C67,C70,C72,C73,C75,C77,D1,D11,D3,D6
`Chr7:11756561`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	108	A1,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A4,A7,A9,B1,B102,B107,B109,B11,B114,B118,B120,B121,B123,B129,B131,B132,B133,B137,B138,B15,B16,B21,B25,B27,B30,B31,B34,B42,B43,B47,B49,B51,B55,B56,B57,B60,B61,B64,B65,B66,B71,B72,B73,B74,B77,B78,B79,B84,B85,B86,B88,B90,B93,B94,B96,B99,C1,C10,C11,C15,C16,C18,C2,C21,C23,C24,C26,C3,C32,C33,C34,C36,C37,C41,C42,C46,C47,C59,C60,C62,C64,C65,C66,C68,C69,C75,C79,C8,C80,C81,C83,C84,C87,C9,D10,D2,D5,D6,D8
`Chr7:11756602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr7:11759328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr7:11763131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B124,B128
`Chr7:11770377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,B71
`Chr7:11771401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr7:11775103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774839.1

906 aa

453

906

RhoGAP

Lzipper-MIP1

PF00169 PH 45-149 aa PF00620 RhoGAP 206-349 aa PF14389 Lzipper-MIP1 588-668 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774839.1`	Pfam	`PF00169`	PH	Domain	45	149	5.5e-13	50.1	PH domain
`XP_057774839.1`	Pfam	`PF00620`	RhoGAP	Domain	206	349	4.1e-31	108.6	RhoGAP domain
`XP_057774839.1`	Pfam	`PF14389`	Lzipper-MIP1	Family	588	668	3.7e-13	50.3	Leucine-zipper of ternary complex factor MIP1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918856.1
GGTAGACCAACACAGAGTGTAAATATCTGTTTTTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGTGTTGAAATCAGAGTAAAAATTTCCGTCCCTCCACACGTTCGTATTTCTTACAGAGAAGGCTCTCTTCTGTCTCTCTCATACAAAAAAATGAGAAACAGAAACGCATTGGTTCCATTTTTTTTATGATCGCCACACCTTGCTTTCCCGTTCCTAAAATAATTTAAGGAATATAGGTTTTATTTGATGAGTTGCCTTTATGTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993818
ATGACGAATGTGAACAACAATGCAGCAGCGGCAGCGGCAGAGTCCTCGCAGGCGGAAGCTGGTGGCGGCAAAAATGAGCCGCCTCCGCCACCTGCACCGCCAAGCCCTGCTCTTCATGCTGGGAGTAAGGTTTACAAAAGTGGCCCACTATTTTTGTCATCAAAAGGAATTGGTTGGACATCGTGGAAGAAAAGGTGGTTCATTTTAACTCAGACTTCCTTAGTCTTCTATAGAAGTGATCCAAACGCAGTTCCTCAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774839.1
MTNVNNNAAAAAAESSQAEAGGGKNEPPPPPAPPSPALHAGSKVYKSGPLFLSSKGIGWTSWKKRWFILTQTSLVFYRSDPNAVPQKSSEVNLTLGGIDLNSSGSVVVKEDKKLLTVLFPDGRDGRAFTLKAETLEDLHEWKAALEEALSNAPNAALVTGQNGMFKNDQSNAADTSSDQAKDRQAAKSLVLGRPILLALEDIDGTPSFLEKALRFIEEHGVKTEGILRQAADVEDVERRIQEYEKGKNEFSLDEDAHVIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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