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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001536`

染色体: Chr07 坐标: 12458383-12460082 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001536`
名称	SmilChr07G001536
描述	uncharacterized SmilChr07G001536
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	12458383 - 12460082 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993823`
GeneID	`130993823`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993823`
原始查询	`SmilChr07G001536`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=44; qcov=0.571; evalue=1.19e-27; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=52.7; qcov=0.761; evalue=1.01e-64; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993823

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774843.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774843.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774843.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774843.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774843.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:12459396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B29,D9
`Chr7:12459402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr7:12459416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr7:12459450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B118,C25,C83
`Chr7:12459450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,C25,C83
`Chr7:12459463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:12459491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C11,C75
`Chr7:12459508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B64,C32,C8,C86
`Chr7:12459530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:12459548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr7:12459600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,B5,C17,C63
`Chr7:12459607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B59,B73,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774843.1

247 aa

124

247

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 60-98 aa PF04827 Plant_tran 167-236 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774843.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	60	98	2.4e-19	69.5	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057774843.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	167	236	9.7e-23	81.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918860.1
ATGGCGAAACACCAGCACGATTCTTCGTCTGATTCATCCGACGGTGTAGCTCACGCGATCATGGAGGAGATAAAGTTGCATAAACATTTGCTTGCTCAAATCTACACCCAACCGGCACCGGAGCCGAGACGTGTTAAGCGTCCCCGGTCTTACGTCTACCGTGATCGTGAGGATGCCCATCTACATCTTATGCAAGACTACTTCGACGATAATCCGACGTACGGGCTTACACTTTTCCGACGTCGTTTTCAAATGCAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993823
ATGGCGAAACACCAGCACGATTCTTCGTCTGATTCATCCGACGGTGTAGCTCACGCGATCATGGAGGAGATAAAGTTGCATAAACATTTGCTTGCTCAAATCTACACCCAACCGGCACCGGAGCCGAGACGTGTTAAGCGTCCCCGGTCTTACGTCTACCGTGATCGTGAGGATGCCCATCTACATCTTATGCAAGACTACTTCGACGATAATCCGACGTACGGGCTTACACTTTTCCGACGTCGTTTTCAAATGCAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774843.1
MAKHQHDSSSDSSDGVAHAIMEEIKLHKHLLAQIYTQPAPEPRRVKRPRSYVYRDREDAHLHLMQDYFDDNPTYGLTLFRRRFQMQKELFLRIVEAVQGEDSYFQMTIDAIGQDSLSHLQKCMPAIRQLAIGVSADNIDEYLKVADSNGRVCLKKFCKAVIRAFRAHYLRRPTGEDITRLTQMHEARHEFPGMLGSLDCMHWGWKNCLKAWHDAYTRDDQGEPTLILEIVASHDLSNANFCTATVPK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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