Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001540`

染色体: Chr07 坐标: 12519326-12520218 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001540`
名称	SmilChr07G001540
描述	uncharacterized SmilChr07G001540
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	12519326 - 12520218 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992690`
GeneID	`130992690`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992690`
原始查询	`SmilChr07G001540`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992690

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057773424.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057773424.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773424.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773424.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773424.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917441.1
CACCACGTTGTGCAAATCCACACTCCAATAAGAAAATCAGTGTCCTCCTTATTTCCAAGATGTACGAAAGCAAGAAAATGGCCCCTCATTGTCTGATTCTCTGCTCTGTGGTTCGACGTCTATGGAAGTCCTCCCCTTGGTGGAAGTGGCTTAAGGATTGCTCTCACATGTCTATGCGAGATATCTTTTTTAAGGTTGCTGATGTGGTGGATGATAGTGAGCTTGATCTGTTCTGTGTCTGCCTTTGGAGGCTCGGGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992690
ATGTACGAAAGCAAGAAAATGGCCCCTCATTGTCTGATTCTCTGCTCTGTGGTTCGACGTCTATGGAAGTCCTCCCCTTGGTGGAAGTGGCTTAAGGATTGCTCTCACATGTCTATGCGAGATATCTTTTTTAAGGTTGCTGATGTGGTGGATGATAGTGAGCTTGATCTGTTCTGTGTCTGCCTTTGGAGGCTCGGGGTTTGTGTGATGCGGAGAACCGCAGCCTTCCCAGGGAAGGAGATTGTCGCTGGGTTCCGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773424.1
MYESKKMAPHCLILCSVVRRLWKSSPWWKWLKDCSHMSMRDIFFKVADVVDDSELDLFCVCLWRLGVCVMRRTAAFPGKEIVAGFRLSGPTCVLMWMWRGKKGAV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器