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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001556`

染色体: Chr07 坐标: 12681256-12683033 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001556`
名称	SmilChr07G001556
描述	transcription factor bHLH93-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	12681256 - 12683033 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992668`
GeneID	`130992668`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992668`
原始查询	`SmilChr07G001556`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor bHLH93-like
产物	transcription factor bHLH93-like
Arabidopsis	`AT5G65640` (bHLH093) beta HLH protein 93 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836690] identity=65.7; qcov=0.764; evalue=1.16e-68; confidence=high
Rice	`Os03g0135700` (RAI1) - identity=60.3; qcov=0.76; evalue=1.35e-59; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH); PF22754 (bHLH-TF_ACT-like_plant)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992668

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773393.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773393.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773393.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773393.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773393.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:12681503`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C81
`Chr7:12681503`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C81
`Chr7:12682392`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A1,A15,A23,A8,B117,B28,B3,B4,B65,B85,B89,B97,C15,C7,C85
`Chr7:12682397`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A1,A15,A23,A8,B117,B28,B3,B4,B65,B85,B89,B97,C15,C7,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773393.1

229 aa

114

229

HLH

bHLH-TF_ACT-like_plant

PF00010 HLH 74-116 aa PF22754 bHLH-TF_ACT-like_plant 148-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773393.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	74	116	1.1e-10	41.9	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057773393.1`	Pfam	`PF22754`	bHLH-TF_ACT-like_plant	Domain	148	220	8.5e-08	32.9	Plant bHLH transcription factor, ACT-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917410.1
CAATTTAGATATTATAAATAATTTATAAAAGTGCCCATTTTTCATATAGATTCAATGGCATGCATGAACATTACAAACTAAACAATCTTCATTGTTTTCAACAATGAAAAAATAGCCAACACAAGTAGCTTCGATTTTTTTTTTTTAGTCTCCATCCCCTTTCTTACCTATATAGCACAAGCTGCGGCAAGCATTGTGGGCTTCACTCTGCTGCATCTGTGTGTGTAAGAGAGAGAGAAATGGAGTTGTACAGAAATGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992668
ATGGAGTTGTACAGAAATGATGAGCATGGTTTCTTGGAAGAGTTACTAGAAATGGAGTCCTTCAGAAATCAAGAAAGCTTGCCTAGTCTTGCTTATATCCCTTCCTACCAACTATCACCGCCCGACTTCAGCTTCATCCAAACGCTCCCTTATGATTTTCAAAATCCCGAACCCCACAGTTTGAACACGAGCCCTCAGAAGCCGGCGTCGAAGAACCTCATGGCGGAGAGACGGCGGCGGAAGCGCCTCAACGACCGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773393.1
MELYRNDEHGFLEELLEMESFRNQESLPSLAYIPSYQLSPPDFSFIQTLPYDFQNPEPHSLNTSPQKPASKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRSVVPKISKMDRASILGDTIDYMRELLGRINNLQEETHLFKDVKPNEILLRNSPKFQVERGNPDTRIEICCGGKPGLLLSTVTTLEALGVDIQQCVISCFNDFALQASCSEDLKKIAILDPEDIKQALLRNTGYGGKCL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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