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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001576`

染色体: Chr07 坐标: 12991271-12996763 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001576`
名称	SmilChr07G001576
描述	amino acid permease 6-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	12991271 - 12996763 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992732`
GeneID	`130992732`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992732`
原始查询	`SmilChr07G001576`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	amino acid permease 6-like
产物	amino acid permease 6-like
Arabidopsis	`AT5G49630` (AAP6) amino acid permease 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835025] identity=77.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0134000` (OsAAP6) - identity=68.6; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992732

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057773449.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057773449.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057773449.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773449.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773449.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:12991459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,B77,C32
`Chr7:12991548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C62,D5
`Chr7:12991553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr7:12991672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,C8
`Chr7:12992051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C5
`Chr7:12992054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B15,B44,B86,C10
`Chr7:12995492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B15,C10
`Chr7:12996548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B23,C23,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773449.1

459 aa

230

459

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 19-446 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773449.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	19	446	2.6e-121	405.9	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917466.1
CCTTCCACGCCACACCACACCACACCACAATTCCCCTACATGGAGTATGAGGAAGCAAGCAAGAGTTTGGACGACGACGGGCGTGTCAAACGGACAGGTACATTGCTGACGGCGAGTTCGCACATCATAACGGCGGTGATAGGGTCGGGAGTGCTGTCGCTGGCGTGGGCGATAGCGCAGCTGGGCTGGGTGGCGGGCCCCGCCGTGCTCATGGCCTTCTCCTTCATCACTTACTTCACCTCCACCCTCCTCGCCGACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992732
ATGGAGTATGAGGAAGCAAGCAAGAGTTTGGACGACGACGGGCGTGTCAAACGGACAGGTACATTGCTGACGGCGAGTTCGCACATCATAACGGCGGTGATAGGGTCGGGAGTGCTGTCGCTGGCGTGGGCGATAGCGCAGCTGGGCTGGGTGGCGGGCCCCGCCGTGCTCATGGCCTTCTCCTTCATCACTTACTTCACCTCCACCCTCCTCGCCGACTCCTACCGCTCCATTCACGGCACCAGAAACTATACCTACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773449.1
MEYEEASKSLDDDGRVKRTGTLLTASSHIITAVIGSGVLSLAWAIAQLGWVAGPAVLMAFSFITYFTSTLLADSYRSIHGTRNYTYMDVVRSHLGGVKVQLCGLAQYGNLVGVTVGYTITASISMVAVRKSNCYHKHGHDAKCSTSTYPFMIIFAAIQIILSQIPNFHELSWLSIVAAVMSFAYSSIGLALSVAKVAGGGDVRTTVTGTTVGVDVTGSEKVWRTFQAIGDIAFAYAYSTVLIEIQDTLKSKPAENKVMKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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