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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001582`

染色体: Chr07 坐标: 13030340-13032589 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001582`
名称	SmilChr07G001582
描述	probable inactive poly [ADP-ribose] polymerase SRO3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13030340 - 13032589 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992739`
GeneID	`130992739`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992739`
原始查询	`SmilChr07G001582`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inactive poly [ADP-ribose] polymerase SRO3
产物	probable inactive poly [ADP-ribose] polymerase SRO3
Arabidopsis	`AT1G32230` (RCD1) WWE protein-protein interaction domain protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840115] identity=28.5; qcov=1.11; evalue=5.44e-66; confidence=low
Rice	`Os03g0230300` (OsSRO1c) - identity=36.3; qcov=0.967; evalue=9e-80; confidence=medium
GO	GO:0003950 (NAD+ poly-ADP-ribosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02825 (WWE); PF12174 (RST); PF23467 (WWE_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992739

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773461.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773461.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773461.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773461.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773461.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13030588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C5
`Chr7:13030691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:13031110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:13031145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C29,C43,C65,C82
`Chr7:13031202`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A6
`Chr7:13031202`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A6
`Chr7:13031271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr7:13031485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B104
`Chr7:13031674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B44
`Chr7:13031876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773461.1

482 aa

241

482

WWE_5

WWE

RST

PF23467 WWE_5 44-123 aa PF02825 WWE 58-113 aa PF12174 RST 424-480 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773461.1`	Pfam	`PF23467`	WWE_5	Domain	44	123	5.9e-25	88.4	WWE domain
`XP_057773461.1`	Pfam	`PF02825`	WWE	Domain	58	113	0.00014	22.9	WWE domain
`XP_057773461.1`	Pfam	`PF12174`	RST	Domain	424	480	1.4e-10	41.6	RCD1-SRO-TAF4 (RST) plant domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917478.1
GTTGTCTTTTCACACTAGGTCCACCGGGGCAATTTCGTCTTTTCGTGGTAACCGACCTGAACAGTGAGGGGTACATAGGCGGCAAATTTTCTTTTCTTCTCCTCAGAAGTTCTTTGCAGAGCTAAATCAGCAGATATTTTACAGAGAGCTTCTCAATTTGTGCGCTTACGTTCAGCCATGAATTCGTTGAATTCCACCTCAATAATGACGAAAAGGTGCGCGGAGGTAAAAAGCAGCGCGAAAGCCTTGGGCCATAGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992739
ATGAATTCGTTGAATTCCACCTCAATAATGACGAAAAGGTGCGCGGAGGTAAAAAGCAGCGCGAAAGCCTTGGGCCATAGATCTTCAGCTGCAACGCGTTGTGAGCCGTTGATCCAGAATTATTCGAATTTTAAGCGGAGCTCGTGCCCGAAGCGCTTGATGTTCTACGAGAACGGATCGTGGGTTGATTATTCGGAGGAAGTGGCGGATTTGTTGAAATTAGGGTTTGCGGAGGGGAGGCCGATGGTTGAGGCTCAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773461.1
MNSLNSTSIMTKRCAEVKSSAKALGHRSSAATRCEPLIQNYSNFKRSSCPKRLMFYENGSWVDYSEEVADLLKLGFAEGRPMVEAQVLGYNCFFDLYRMLEIDLESGNQRSIAWIDADGKCFFPKTFVDSCENDREVELVDGDKSCAKIEIDIKIVENSGNHEGVGLKEDVNFGKRGRSENVEKGKVEESFCGTAAKRLKMVESESQSSRWPKARNLAAGEKRYAIVKNLFLSGLENVEPGARITSIHQCVRMGPLDKAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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