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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001587`

染色体: Chr07 坐标: 13114433-13116377 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001587`
名称	SmilChr07G001587
描述	UPF0496 protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13114433 - 13116377 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993831`
GeneID	`130993831`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993831`
原始查询	`SmilChr07G001587`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0496 protein 1-like
产物	UPF0496 protein 1-like
Arabidopsis	`AT4G34320` (AT4G34320) transmembrane protein, putative (DUF677) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829582] identity=49.6; qcov=0.727; evalue=6.04e-31; confidence=medium
Rice	`Os03g0199100` - identity=64.4; qcov=0.587; evalue=9.53e-36; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05055 (DUF677)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993831

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057774851.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057774851.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057774851.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774851.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774851.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13115763`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A4,B108,B125,B126,B17,B25,B47,B56,B63,B65,B83,C17,C22,C25,C40,D6
`Chr7:13115775`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B12,B126,B138,B55,B78,C46,C52,C71,D3
`Chr7:13115777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B134,B137,C11
`Chr7:13115813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B118,C32,C74
`Chr7:13115834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B51,B69,B82,B89,D10
`Chr7:13115845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,B61,C84
`Chr7:13115870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr7:13115885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B78,C81,C84
`Chr7:13115895`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C8
`Chr7:13115895`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C8
`Chr7:13115915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A15,A21,A23,B131,B27,B45,B62,B66,B91,C25,C33,C57,C64,C66,C73,C80,C82,C83
`Chr7:13115936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B12,B14,B47,B80,B84,C10,C49,C50,C55,C71,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774851.1

172 aa

172

DUF677

PF05055 DUF677 69-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774851.1`	Pfam	`PF05055`	DUF677	Family	69	158	1.6e-22	80.6	Protein of unknown function (DUF677)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918868.1
ATGGCCCGTGCGAAAGCGATATTTGAGCGTTACAATCACGTGTTGCAAAATAGGTTGAGCCGAACGTTCCGCCGCGCCGGCAGCCTCCGTGCGCCGGCGGCGGCTGAGCCACCTGCTGCAAATCATGACCTCAGCTCCTCCAATTTTACTTCCGCCGACTCCGATCTGAGCTCGTACGAAGCGGCGTGCCGCTCCGACCCCGACCTCCAAAACTTCGACTCGAAGCTCCAGATCCGCACAAGCCGCGCCATCAACTCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993831
ATGGCCCGTGCGAAAGCGATATTTGAGCGTTACAATCACGTGTTGCAAAATAGGTTGAGCCGAACGTTCCGCCGCGCCGGCAGCCTCCGTGCGCCGGCGGCGGCTGAGCCACCTGCTGCAAATCATGACCTCAGCTCCTCCAATTTTACTTCCGCCGACTCCGATCTGAGCTCGTACGAAGCGGCGTGCCGCTCCGACCCCGACCTCCAAAACTTCGACTCGAAGCTCCAGATCCGCACAAGCCGCGCCATCAACTCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774851.1
MARAKAIFERYNHVLQNRLSRTFRRAGSLRAPAAAEPPAANHDLSSSNFTSADSDLSSYEAACRSDPDLQNFDSKLQIRTSRAINSISVVLDVRSLPLDSLREVTEYLLEMNQEVVTITLQNKRDIWKDDEFSDLVVFENCLLTLDFCTTLDSCLKRVAVVVAGISDFSIKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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