当前解析结果
SmilChr07G001588| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001588 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001588 |
| 描述 | EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 2 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 13116479 - 13117554 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995298 |
|---|---|
| GeneID | 130995298 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995298 |
| 原始查询 | SmilChr07G001588 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 2 |
| 产物 | EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 2 |
| Arabidopsis | AT4G37810 (AT4G37810)EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829937] identity=45; qcov=0.854; evalue=4.72e-27; confidence=medium |
| Rice | Os07g0132300 (OJ1606_D04.120)- identity=34.7; qcov=0.931; evalue=9.08e-15; confidence=low |
| GO | GO:0010052 (guard cell differentiation); GO:0010374 (stomatal complex development) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF17181 (EPF) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995298 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057776519.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057776519.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057776519.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057776519.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057776519.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057776519.1PF17181
EPF 51-127 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057776519.1 |
Pfam | PF17181 |
EPF | Family | 51 | 127 | 5.1e-15 | 55.9 | Epidermal patterning factor proteins |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。