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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001589`

染色体: Chr07 坐标: 13120939-13124917 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001589`
名称	SmilChr07G001589
描述	putative lipase ROG1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13120939 - 13124917 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995299`
GeneID	`130995299`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995299`
原始查询	`SmilChr07G001589`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative lipase ROG1
产物	putative lipase ROG1
Arabidopsis	`AT1G10040` (AT1G10040) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837539] identity=63.2; qcov=0.855; evalue=1.22e-153; confidence=high
Rice	`Os03g0726800` (OSJNBb0122C16.16) - identity=55.9; qcov=0.818; evalue=4.73e-135; confidence=high
GO	GO:0044255 (GO:0044255)
KEGG	-
Pfam	PF05057 (DUF676)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995299

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057776520.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057776520.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057776520.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776520.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776520.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13121551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B75,C72,D7
`Chr7:13121566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C82
`Chr7:13122102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr7:13122968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B137,B15,B86,C10
`Chr7:13123148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:13123360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,C2,C21
`Chr7:13124566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr7:13124632`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A15,A24,A7,B133,B16,B19,B53,B95,C29,C54
`Chr7:13124723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:13124735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776520.1

413 aa

206

413

DUF676

PF05057 DUF676 74-305 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776520.1`	Pfam	`PF05057`	DUF676	Family	74	305	4.6e-67	226.4	Putative serine esterase (DUF676)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920537.1
TCTCTAGAAACGATTTTGGAGAAAATTAATTAATGCGCCATTTCTAGAAGTAATTGATTCAAATGCGTTGAATCGTACGCCTTTCAAGTCAGCCATGGCGCTTCCATTTCTTTAACTAACTTCTCAACAGAAACACATTTGGTAATCAATCATACATTTCGACCACCATACTTCAATGGAGACGGAGAATAACAGAGCACAAAGTGTGAAAGAAGAGAGAGAGATGGAAAACAAGCTTGGCAGTCGGAACACCATGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995299
ATGGAGACGGAGAATAACAGAGCACAAAGTGTGAAAGAAGAGAGAGAGATGGAAAACAAGCTTGGCAGTCGGAACACCATGAAAAAGGAAGAGAAGAAGAAGTTGAGCTTTATTCCGAGATTTCCGTGTATGAGAGTAGACGACAGCGTTCCGGCGGTGGAGACGCCAGCCGCCGACGGTGGTTTCGACATGGAGGCTGCTTGCAAGGGGAGGGACCACTCACCGACGCACCTCGTTGTTACGATCAATGGGATTATTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776520.1
METENNRAQSVKEEREMENKLGSRNTMKKEEKKKLSFIPRFPCMRVDDSVPAVETPAADGGFDMEAACKGRDHSPTHLVVTINGIIGSAQNWRYAAKQFMKAYPDDVIVHCSQSNTSMLTFDGVDVMGKRLADEVISVVGRHPKLQKISFLGHSLGGVIARYAIAVLYQQNVTPKHGEQNGEHVGDESHRSSLEEKQRGYIAGLEPVNFITFATPHLGSRGHKQVPAFCGLYTMEKLASRASFLLGRTGKHLFLNDSDDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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