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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001602`

染色体: Chr07 坐标: 13375301-13377433 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001602`
名称	SmilChr07G001602
描述	growth-regulating factor 2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13375301 - 13377433 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995309`
GeneID	`130995309`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995309`
原始查询	`SmilChr07G001602`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	growth-regulating factor 2-like
产物	growth-regulating factor 2-like
Arabidopsis	`AT4G37740` (GRF2) growth-regulating factor 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829930] identity=70.8; qcov=0.349; evalue=1.67e-54; confidence=low
Rice	`Os03g0729500` (GRF6) - identity=73.5; qcov=0.315; evalue=6.34e-54; confidence=low
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0032502 (developmental process)
KEGG	-
Pfam	PF08879 (WRC); PF08880 (QLQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995309

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776530.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776530.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776530.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776530.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057776530.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13375751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B6,B63,B7
`Chr7:13375787`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A19,A22,B1,B18,B2,B41,B6,B63,B64,B7,B73,B74,B86,B88,B99,C13,C19,C29,C3,C63,C67
`Chr7:13375788`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A19,A22,B1,B18,B2,B41,B6,B63,B64,B7,B73,B74,B86,B88,B99,C13,C19,C29,C3,C63,C67
`Chr7:13375814`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A19,A22,A4,B1,B12,B130,B18,B2,B41,B6,B63,B64,B7,B73,B74,B86,B88,B99,C13,C19,C3,C63,C67
`Chr7:13376482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr7:13376577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B13,B99,C71,C75
`Chr7:13376902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B44,C33,C46
`Chr7:13376955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr7:13377019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B18,B23,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776530.1

372 aa

186

372

QLQ

WRC

PF08880 QLQ 117-151 aa PF08879 WRC 181-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776530.1`	Pfam	`PF08880`	QLQ	Domain	117	151	5.1e-16	58.7	QLQ
`XP_057776530.1`	Pfam	`PF08879`	WRC	Domain	181	223	4.2e-21	75.1	WRC

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920547.1
GTGTGTGTATGTAGAGGAGTAACAAGTAGTGAAGTTTTTGTCACAAACCTCTGAGACAACCCCTCTTTCTCTCTCTCTCCAATAATTTTTCCTTTGACAAACATCAAACTCACTAAACAAGAAGCAGTGCGATTCCCCCTTTTGAAGTCTGCTCAACCAAACATAGCACCCGCAGCACTCCAACAAGAGAAAAGAGAAGATGCTACTTCCTGTCTCCTTCCGCCATTGCACTTGCACCTAATCCTCTTTCTCTATCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995309
ATGGATTTCGCCCTCCTCGCCTCCGACACCAATCTCTTACAAAATGCTAATGCTGATGCCGACAAGCAGAAATGCTACGGATTCGGATTTCTGAAGCAAGATAGAGCAATAAATGAAGAAGATTTTAGGGAGTTTAAGATGGCCAAGACTTCATCCTGCGGTGAGGGTGCGCTCAGATACCCGCCTCACAGATCCAACGGCTGTAGTCTCTCCTCCCCACAAGCCCATCACCAAATGCTCAGCTTTTCTTCCCCAAACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776530.1
MDFALLASDTNLLQNANADADKQKCYGFGFLKQDRAINEEDFREFKMAKTSSCGEGALRYPPHRSNGCSLSSPQAHHQMLSFSSPNSQPYYHYSSNAFARINAGINGGMQQQGVRGPFTPSQWMELEHQALIYKYITANVPIPSYLLNPIRKAFEAAGFSALRSNPLGWGGFHLGFSNTDPEPGRCRRTDGKKWRCSRDAVVDQKYCERHMNRGRHRSRKPVEGQSGHAAATKSVVELSKIKPKDGGVREWERHEFGLVC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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