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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001617`

染色体: Chr07 坐标: 13551815-13556186 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001617`
名称	SmilChr07G001617
描述	uncharacterized SmilChr07G001617
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13551815 - 13556186 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995321`
GeneID	`130995321`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995321`
原始查询	`SmilChr07G001617`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	37S ribosomal protein S27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834500]; symbol=AT5G44710; hit=AT5G44710; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	37S ribosomal protein S27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834500]; symbol=AT5G44710; hit=AT5G44710; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G44710` (AT5G44710) 37S ribosomal protein S27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834500] identity=69.8; qcov=0.897; evalue=1.77e-46; confidence=medium
Rice	`Os05g0148300` - identity=64.6; qcov=0.897; evalue=2.44e-42; confidence=medium
GO	GO:0005739 (mitochondrion)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF08293 (MRP-S33)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995321

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057776548.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057776548.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776548.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776548.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776548.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13552064`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A16,A24,B58,B95,C52,C70
`Chr7:13552067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B110,B71,B77,B9
`Chr7:13552941`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	A1,A18,B107,B127,B129,B134,B15,B25,B33,B39,B5,B54,B63,B73,C1,C2,C24,C55,C56,C66,C71,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776548.1

107 aa

107

MRP-S33

PF08293 MRP-S33 22-96 aa

XP_057776549.1

107 aa

107

MRP-S33

PF08293 MRP-S33 22-96 aa

XP_057776550.1

107 aa

107

MRP-S33

PF08293 MRP-S33 22-96 aa

XP_057776551.1

107 aa

107

MRP-S33

PF08293 MRP-S33 22-96 aa

XP_057776552.1

107 aa

107

MRP-S33

PF08293 MRP-S33 22-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776548.1`	Pfam	`PF08293`	MRP-S33	Family	22	96	3.5e-15	56.7	Mitochondrial ribosomal subunit S27
`XP_057776549.1`	Pfam	`PF08293`	MRP-S33	Family	22	96	3.5e-15	56.7	Mitochondrial ribosomal subunit S27
`XP_057776550.1`	Pfam	`PF08293`	MRP-S33	Family	22	96	3.5e-15	56.7	Mitochondrial ribosomal subunit S27
`XP_057776551.1`	Pfam	`PF08293`	MRP-S33	Family	22	96	3.5e-15	56.7	Mitochondrial ribosomal subunit S27
`XP_057776552.1`	Pfam	`PF08293`	MRP-S33	Family	22	96	3.5e-15	56.7	Mitochondrial ribosomal subunit S27

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920569.1
GGCTCCCCCACTGATTTAGCCACCTCATCGAGACCAGTACAAAACCCTCAAGCCGGCTAAAGAGTTTGGAGACATAGCAGCACATTCAAGAAAAGAAATTGTAAGGTTGAGGAGATGAGTGTTGGGAACAGCTTAGGAGGAGGCTTGAAGAAAGTGCTGGCTGAAGTGGCCATCAAAGGAGTCACTGAGGCTAGAGCTAGGATTTTCGGTCATATTCTTAACCCAACTGGTCAAAGATCCCCCCACAAAGTACTTCGCAA...

XM_057920565.1
GTGAATTTACAAAATGAAAAAGTAACTTTCATCTTCTCAACTCACTCTCTCAAATTCCTAAATTGAAAATTCCAGAATACTTAATTGCTCGTCCCCACCCATCTTTCTTTTATACTTCTTGAGCCCTAATTGCCCTCTCCCTCGTTTGCATCTTCAATTCCAGAGTTTGGAGACATAGCAGCACATTCAAGAAAAGAAATTGTAAGGTTGAGGAGATGAGTGTTGGGAACAGCTTAGGAGGAGGCTTGAAGAAAGTGCTG...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC130995321
ATGAGTGTTGGGAACAGCTTAGGAGGAGGCTTGAAGAAAGTGCTGGCTGAAGTGGCCATCAAAGGAGTCACTGAGGCTAGAGCTAGGATTTTCGGTCATATTCTTAACCCAACTGGTCAAAGATCCCCCCACAAAGTACTTCGCAAGAAGCTAATTGGTGACAAAGTTGCAGCTTGGTATCCTTATGATATCAACAGGGATGATCCCAGTGTGATGCATGCTCAGGAACAAGTGCGATTGAATAGGCTTGAAATGTTGAA...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057776548.1
MSVGNSLGGGLKKVLAEVAIKGVTEARARIFGHILNPTGQRSPHKVLRKKLIGDKVAAWYPYDINRDDPSVMHAQEQVRLNRLEMLKRRQKGPPKKGQGKRAKKSGR

XP_057776549.1
MSVGNSLGGGLKKVLAEVAIKGVTEARARIFGHILNPTGQRSPHKVLRKKLIGDKVAAWYPYDINRDDPSVMHAQEQVRLNRLEMLKRRQKGPPKKGQGKRAKKSGR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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