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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001630`

染色体: Chr07 坐标: 13660277-13664255 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001630`
名称	SmilChr07G001630
描述	U-box domain-containing protein 4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13660277 - 13664255 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995332`
GeneID	`130995332`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995332`
原始查询	`SmilChr07G001630`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 4
产物	U-box domain-containing protein 4
Arabidopsis	`AT3G01400` (AT3G01400) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821320] identity=83.9; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0587500` - identity=57.8; qcov=1.01; evalue=1e-130; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF00514 (Arm); PF25598 (ARM_PUB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995332

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057776562.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057776562.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057776562.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776562.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776562.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13660890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:13660920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr7:13660950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr7:13661166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr7:13661194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr7:13661543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr7:13661547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776562.1

350 aa

175

350

ARM_PUB

Arm

PF25598 ARM_PUB 69-339 aa PF00514 Arm 94-132 aa PF00514 Arm 135-173 aa PF00514 Arm 177-214 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776562.1`	Pfam	`PF25598`	ARM_PUB	Repeat	69	339	6.3e-20	72.5	Plant U-box protein ARM repeat region
`XP_057776562.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	94	132	3.1e-33	113.4	Armadillo/beta-catenin-like repeat
`XP_057776562.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	135	173	3.1e-33	113.4	Armadillo/beta-catenin-like repeat
`XP_057776562.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	177	214	3.1e-33	113.4	Armadillo/beta-catenin-like repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920579.1
TAAAAAATTTATGACATAACTTGAAGGTTTGACAAATCTGTATTAAAATCGCAAAATGAGTGATTTCTTTTCATAAATCTGCAATGAATCCATAAAAAACTAGTCCTAAAGAAAGGGTAAATAGAGATAAAAAGAAAAAAAAGTAAAGGGAGTGTAATGTATGGAATGCCGAACCTTCCCCGCACGCGTTAAAAGCTGAGACACCTCACACGTGCTGTCGCGATTGGGATTCTGTACGGCTATCCACGTGGCACCTTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995332
ATGGATTCCGATTCAGTGAAATCGAGCTTCACCTACATGGGGCGCAAGTTCAGCGATATCAGCCTCAACGACTCCTCCTCCTCCGCCTTCAGCGACTGCAACAGCGACAGATCCGGCGAGTTCCCCACGGCGTCGTCGCAGAGCCGCCGCCTCTTCCTCTCCTGCGCCTCCGACAATTCCGACGAGCTCATCTCGCAGCTCGTCTCCGCCCTCGATTCCGACAACATCGACGAGCAGAAGCAGGCCGCCATGGAATTGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776562.1
MDSDSVKSSFTYMGRKFSDISLNDSSSSAFSDCNSDRSGEFPTASSQSRRLFLSCASDNSDELISQLVSALDSDNIDEQKQAAMELRLMAKNKPENRIKIARAGAIKPLISIISSNDLQLQEYGVTAVLNLSLCDENKEEIAYSGAIKPLVRALKAGTSTARENAACALLRLSQIEENKVAIGRSGAIPPLVNLLESGNFRGMKDACTALYSLCTVKENKIRAVQAGILKPLVELMSDLGSNMVDKSAFVLSLLMSVPEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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