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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001631`

染色体: Chr07 坐标: 13667965-13670719 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001631`
名称	SmilChr07G001631
描述	rho GTPase-activating protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13667965 - 13670719 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995333`
GeneID	`130995333`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995333`
原始查询	`SmilChr07G001631`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rho GTPase-activating protein 2-like
产物	rho GTPase-activating protein 2-like
Arabidopsis	`AT4G03100` (AT4G03100) Rho GTPase activating protein with PAK-box/P21-Rho-binding domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828092] identity=56.4; qcov=0.986; evalue=4.21e-146; confidence=high
Rice	`Os12g0533400` - identity=59.3; qcov=0.795; evalue=2.84e-133; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF00620 (RhoGAP); PF00786 (PBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995333

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057776563.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057776563.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057776563.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776563.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776563.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13668235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:13668289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:13668298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:13668306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:13668475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr7:13668480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:13668579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr7:13668882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr7:13669297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:13670237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:13670276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr7:13670327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776563.1

414 aa

207

414

PBD

RhoGAP

PF00786 PBD 60-88 aa PF00620 RhoGAP 123-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776563.1`	Pfam	`PF00786`	PBD	Domain	60	88	4.4e-05	24.4	P21-Rho-binding domain
`XP_057776563.1`	Pfam	`PF00620`	RhoGAP	Domain	123	257	1.1e-19	71.5	RhoGAP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920580.1
TCGTTTTATGTAATTTCCTAATTTTTTTAACAACAAGAAGTAGGAGTATTAATTAATTAAGAATATAATAGTATAGGCGAAGAGATAACTTTTCCGAAACATAAATACTTTCCGAAAGAGAGAATTCCGAAGTGGTGATATCAAAATTTGAAATTTATGCCGTTTGAATAAAGTAATCAACTTTTCAATCTCCAAGGCCCTCTTTTCTTGAATGCAACTCAGAGTGAGAGAGGGAGGATGGTGACAAGGGGTGGAGGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995333
ATGGTGACAAGGGGTGGAGGGAGGAGCTTAGAATCCGGTGCGGCGGAGGATGAGGAGAAGCAGCAACAGCTGTCTTACTTGCACTCCATTTTATCTGCTTTGAGAAAATCCATGGTGTCAACGTGCCGCGTCGCTGAGCAAGATGAAGAAGAGGTGATCTCAGCCGTCCATCACATGGAAATCGGGTGGCCCACAAACGTCAAGCACATAACTCATGTCACTTTCGATAGATTCCATGGCTTTCTCGGATTGCCTCTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776563.1
MVTRGGGRSLESGAAEDEEKQQQLSYLHSILSALRKSMVSTCRVAEQDEEEVISAVHHMEIGWPTNVKHITHVTFDRFHGFLGLPLEFEVEIPCKAPSASVSVCGVSADSMKWSYDARCNSVPTILLLMQEKLYALGGLKAEGIFRINPENSKEGHVREHLNKGIVPDEIDVHCLASLIKAWFRELPSGVLDGLSPQQVLQCEAEDDCVELLKQLRPTESCLLGWAIDLMADVVENEDSNKMSARNIAMVFAPNMTKMSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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