当前解析结果
SmilChr07G001639| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001639 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001639 |
| 描述 | wee1-like protein kinase |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 13829470 - 13833141 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995343 |
|---|---|
| GeneID | 130995343 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995343 |
| 原始查询 | SmilChr07G001639 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | wee1-like protein kinase |
| 产物 | wee1-like protein kinase |
| Arabidopsis | AT1G02970 (WEE1)WEE1-like kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839453] identity=57.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os02g0135300 (Ores)- identity=59.4; qcov=0.88; evalue=1.21e-177; confidence=high |
| GO | GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995343 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057776576.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057776576.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.40000 | XP_057776576.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057776576.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057776576.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:13829907 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B135 |
Chr7:13829922 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B135,B26,C28,C5,C82 |
Chr7:13829935 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B26,C28,C5,C82 |
Chr7:13830573 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C33,C46 |
Chr7:13831306 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B97 |
Chr7:13831972 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:13831986 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B25,C16 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057776576.1PF00069
Pkinase 228-471 aa
PF07714
PK_Tyr_Ser-Thr 231-468 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057776576.1 |
Pfam | PF00069 |
Pkinase | Domain | 228 | 471 | 2.1e-48 | 165.7 | Protein kinase domain |
XP_057776576.1 |
Pfam | PF07714 |
PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 231 | 468 | 9.2e-25 | 88.1 | Protein tyrosine and serine/threonine kinase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。