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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001644`

染色体: Chr07 坐标: 13869105-13870388 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001644`
名称	SmilChr07G001644
描述	uncharacterized SmilChr07G001644
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13869105 - 13870388 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993845`
GeneID	`130993845`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993845`
原始查询	`SmilChr07G001644`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=40.4; qcov=0.912; evalue=2.03e-86; confidence=medium
Rice	`Os05g0311600` - identity=54.4; qcov=0.251; evalue=2.98e-37; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993845

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774866.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057774866.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774866.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774866.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774866.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13869165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C16,C48
`Chr7:13869220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr7:13869302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:13869373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B131,B56,B96
`Chr7:13869471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:13869514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B138,B31,B84
`Chr7:13869636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:13869773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B89,C44,C6
`Chr7:13869784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr7:13869863`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A15,B111,B113,B122,B2,B70,B86,C21,C29
`Chr7:13869906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr7:13869926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,C36,C45,C83,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774866.1

410 aa

205

410

DUF4371

PF14291 DUF4371 151-374 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774866.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	151	374	2.3e-69	234.3	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918883.1
ATGGAGCATCAACATATTGCAAAGAAAGGAAAAGGACTTATATCTTCTTTCTTTAAGAAACGTGATCGTCAAGATACTCAAGACAATGGAGATAGCTTGGAATCTTCAAATTCAACCATGGCCGCTGGAAATCAAACTAATCAATCTCCTTCACCTCCTATGGAGCAAAATTCAGTTACATGTATTGAGCGTGATCCGGGTAAAAGGAAACAATTGTGTGAATATTCTGTTAATGCACGAGATGATATAAGACGTGCATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993845
ATGGAGCATCAACATATTGCAAAGAAAGGAAAAGGACTTATATCTTCTTTCTTTAAGAAACGTGATCGTCAAGATACTCAAGACAATGGAGATAGCTTGGAATCTTCAAATTCAACCATGGCCGCTGGAAATCAAACTAATCAATCTCCTTCACCTCCTATGGAGCAAAATTCAGTTACATGTATTGAGCGTGATCCGGGTAAAAGGAAACAATTGTGTGAATATTCTGTTAATGCACGAGATGATATAAGACGTGCATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774866.1
MEHQHIAKKGKGLISSFFKKRDRQDTQDNGDSLESSNSTMAAGNQTNQSPSPPMEQNSVTCIERDPGKRKQLCEYSVNARDDIRRAYLKAGPYQPKMEAYPVKKFGTQNRNFQKRWFDKFHWLEYSLSTNKAYCFYCFLFISEVNLPDSSALVKEGFDNWKIINQGKNCAFLTHVGSAATSPHTMCLRRAKDLMRPVGHIDKVMHSQTIIEKERNRLRLKTWITSLRWLALQGCAFRGHDESSSSSNRGNFIELMKAFAN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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