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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001647`

染色体: Chr07 坐标: 13901870-13909140 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001647`
名称	SmilChr07G001647
描述	universal stress protein PHOS34-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13901870 - 13909140 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995348`
GeneID	`130995348`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995348`
原始查询	`SmilChr07G001647`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	universal stress protein PHOS34-like
产物	universal stress protein PHOS34-like
Arabidopsis	`AT2G47710` (AT2G47710) Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819384] identity=71.6; qcov=0.981; evalue=1.15e-79; confidence=high
Rice	`Os12g0552500` - identity=68.2; qcov=0.994; evalue=1.16e-77; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00582 (Usp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995348

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057776584.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057776584.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057776584.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057776584.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776584.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13902203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C3,C49,C63,C82
`Chr7:13902477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B50,B89,D3
`Chr7:13908679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C16,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776584.1

159 aa

159

Usp

PF00582 Usp 6-153 aa

XP_057776585.1

158 aa

158

Usp

PF00582 Usp 6-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776584.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	6	153	3.1e-25	90.1	Universal stress protein family
`XP_057776585.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	6	152	1.9e-25	90.7	Universal stress protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920601.1
GGATGATTAAAATTTAGAACAGAGAATCTGGTCCTACCCGTATCAAATGAGTGCGCACGAAACTAGAAGCTTCGGGTAATCTCGAAGCAAAACAAGCAGCTGATTGGAGTACCGGTTTTACGCACCTAGCTTCCACGACTCATATTTCTATTTAAGAATCCACTTACCAAAAGCCTCTCCACTTAATCCAAACTCAATTTCTTAGCTATAAATTTAGCTTCAATAAAAAAATTAACCCATGGAGAAATCTGTAATGGTGG...

XM_057920602.1
GGATGATTAAAATTTAGAACAGAGAATCTGGTCCTACCCGTATCAAATGAGTGCGCACGAAACTAGAAGCTTCGGGTAATCTCGAAGCAAAACAAGCAGCTGATTGGAGTACCGGTTTTACGCACCTAGCTTCCACGACTCATATTTCTATTTAAGAATCCACTTACCAAAAGCCTCTCCACTTAATCCAAACTCAATTTCTTAGCTATAAATTTAGCTTCAATAAAAAAATTAACCCATGGAGAAATCTGTAATGGTGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995348
ATGGAGAAATCTGTAATGGTGGTGGGGATAGATGACAGCGATCACAGCTTCTACGCTTTGGAGTGGACTCTGCAACACTTCTTCTCCGCTTCGCCGGAGAATTCTCCGTTCAAGATCGTCGTCGTCCACGCCAAGCCGTCGGCTCTCGCCACTGTCGGCCTCGCGGGCCCCGTAGGTGCTGCTGATGTGCTGCCGTATGTGGATATGGATTTGAAGAAGATTGCTGCTAGGGTTATTGAGAAGGCCAAGGAAATTTGTGC...

LOC130995348
ATGGAGAAATCTGTAATGGTGGTGGGGATAGATGACAGCGATCACAGCTTCTACGCTTTGGAGTGGACTCTGCAACACTTCTTCTCCGCTTCGCCGGAGAATTCTCCGTTCAAGATCGTCGTCGTCCACGCCAAGCCGTCGGCTCTCGCCACTGTCGGCCTCGCGGGCCCCGGTGCTGCTGATGTGCTGCCGTATGTGGATATGGATTTGAAGAAGATTGCTGCTAGGGTTATTGAGAAGGCCAAGGAAATTTGTGCTGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776584.1
MEKSVMVVGIDDSDHSFYALEWTLQHFFSASPENSPFKIVVVHAKPSALATVGLAGPVGAADVLPYVDMDLKKIAARVIEKAKEICAAKSVNDVIYEVAEGDARNALCDAVENHHASVLVVGSHGYGAIKRAVLGSVSDYCAHHAHCSVMIVKKPKIKH

XP_057776585.1
MEKSVMVVGIDDSDHSFYALEWTLQHFFSASPENSPFKIVVVHAKPSALATVGLAGPGAADVLPYVDMDLKKIAARVIEKAKEICAAKSVNDVIYEVAEGDARNALCDAVENHHASVLVVGSHGYGAIKRAVLGSVSDYCAHHAHCSVMIVKKPKIKH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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