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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001668`

染色体: Chr07 坐标: 14133301-14144026 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001668`
名称	SmilChr07G001668
描述	uncharacterized SmilChr07G001668
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	14133301 - 14144026 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995367`
GeneID	`130995367`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995367`
原始查询	`SmilChr07G001668`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Small nuclear ribonucleoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819377]; symbol=AT2G47640; hit=AT2G47640; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Small nuclear ribonucleoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819377]; symbol=AT2G47640; hit=AT2G47640; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G47640` (AT2G47640) Small nuclear ribonucleoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819377] identity=83.3; qcov=1; evalue=1.61e-62; confidence=high
Rice	`Os05g0314100` - identity=83.5; qcov=0.954; evalue=2.03e-58; confidence=high
GO	GO:0000387 (spliceosomal snRNP assembly); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005682 (U5 snRNP); GO:0005685 (U1 snRNP); GO:0005686 (U2 snRNP); GO:0008380 (RNA splicing); GO:0046540 (U4/U6 x U5 tri-snRNP complex); GO:0071011 (precatalytic spliceosome); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01423 (LSM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995367

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776611.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057776611.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776611.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776611.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776611.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:14134810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:14134858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:14134864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C3
`Chr7:14134872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C3
`Chr7:14142908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:14143476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776611.1

108 aa

108

LSM

PF01423 LSM 28-103 aa

XP_057776612.1

108 aa

108

LSM

PF01423 LSM 35-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776611.1`	Pfam	`PF01423`	LSM	Domain	28	103	7.3e-18	64.7	LSM domain
`XP_057776612.1`	Pfam	`PF01423`	LSM	Domain	35	103	4.8e-16	58.9	LSM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092138.1
ATTCCATAAAACCCTAGCTAACAAAACCCCCGTACTCGTCATTGGTGAGTTCGTCGTTCTTTCAAATTAATTGCTTTCAGGCTGTAAACTTTTGGTTGGTTGAAGTTCTACATTCGTTGAATCTCCGGTGAAAATGAGTCGGCCAATGGAAGAAGATGCTCCGGCAAAGAATGAGGAGGAGGAGTTCAACACTGGTCCACTTTCTGTCTTGATGTTGAGTGTTAAGAATAACACACAGGTGCTCATCAGCTGCCGTAACA...

XR_009092137.1
ATTCCATAAAACCCTAGCTAACAAAACCCCCGTACTCGTCATTGGTGAGTTCGTCGTTCTTTCAAATTAATTGCTTTCAGGCTGTAAACTTTTGGTTGGTTGAAGTTCTACATTCGTTGAATCTCCGGTGAAAATGAGTCGGCCAATGGAAGAAGATGCTCCGGCAAAGAATGAGGAGGAGGAGTTCAACACTGGTCCACTTTCTGTCTTGATGTTGAGTGTTAAGAATAACACACAGGTGCTCATCAGCTGCCGTAACA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995367
ATGAGTCGGCCAATGGAAGAAGATGCTCCGGCAAAGAATGAGGAGGAGGAGTTCAACACTGGTCCACTTTCTGTCTTGATGTTGAGTGTTAAGAATAACACACAGGTGCTCATCAGCTGCCGTAACAACAAAAAGCTTCTGGGCCATGTGAGGGCTTTTGATCGCCACTGCAACATGGTCCTCGAAAATGTCCGGGAGATGTGGACTGAGGTGCCTAAGACTGGTAAAGGCAAAAAGAAAGCTCTTCCAGTTAACAAGGA...

LOC130995367
ATGAGTCGGCCAATGGAAGAAGATGCTCCGGCAAAGAATGAGGAGGAGGAGTTCAACACTGGTCCACTTTCTGTCTTGATAATTGTTGAGCTTTTCCACTTTCATGTGCTCATCAGCTGCCGTAACAACAAAAAGCTTCTGGGCCATGTGAGGGCTTTTGATCGCCACTGCAACATGGTCCTCGAAAATGTCCGGGAGATGTGGACTGAGGTGCCTAAGACTGGTAAAGGCAAAAAGAAAGCTCTTCCAGTTAACAAGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776611.1
MSRPMEEDAPAKNEEEEFNTGPLSVLMLSVKNNTQVLISCRNNKKLLGHVRAFDRHCNMVLENVREMWTEVPKTGKGKKKALPVNKDRFISKMFLRGDSVIIVLRNPK

XP_057776612.1
MSRPMEEDAPAKNEEEEFNTGPLSVLIIVELFHFHVLISCRNNKKLLGHVRAFDRHCNMVLENVREMWTEVPKTGKGKKKALPVNKDRFISKMFLRGDSVIIVLRNPK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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