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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001707`

染色体: Chr07 坐标: 14470863-14477993 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001707`
名称	SmilChr07G001707
描述	uncharacterized SmilChr07G001707
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	14470863 - 14477993 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995395`
GeneID	`130995395`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995395`
原始查询	`SmilChr07G001707`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF03004 (Transposase_24); PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995395

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776647.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057776647.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776648.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776648.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776648.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:14476896`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B128,B30,B70,C4,C42,C79
`Chr7:14476920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,C33,C69
`Chr7:14476949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B20,B97,C13,C55
`Chr7:14477005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B80,D7
`Chr7:14477044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B131,C30
`Chr7:14477056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:14477102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:14477112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B17,B41,C36,C64
`Chr7:14477143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B45,C3,C48
`Chr7:14477159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C56,D7
`Chr7:14477167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A18,A7,B103,B135
`Chr7:14477206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B68,B8,B97,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776647.1

770 aa

385

770

Transposase_21

DUF4218

DUF4216

PF02992 Transposase_21 1-148 aa PF13960 DUF4218 337-450 aa PF13952 DUF4216 616-689 aa

XP_057776648.1

384 aa

192

384

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 165-297 aa

XP_057776649.1

384 aa

192

384

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 165-297 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776647.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	1	148	5.6e-43	147.3	Transposase family tnp2
`XP_057776647.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	337	450	6.3e-43	146.0	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057776647.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	616	689	1.9e-19	70.7	Domain of unknown function (DUF4216)
`XP_057776648.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	165	297	1.2e-14	55.4	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)
`XP_057776649.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	165	297	1.2e-14	55.4	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920665.1
TTTTTTTTTTGAATTTTGATATATTTTTAATGTAACGACCGTTTCTAACGGTCGTTGTATTTTAATTTATTTAAATTTGAGTTCTGATATTTTTAAGTTTTCGGAAATATTTAACGACCGTTTTTTAACGGTCGTTGTATTTTAATTTATTTAAATATATTTAATATTAACGACCGAAATAATTATTTATAACGACCGTGTTTCGGTCGTTGTATACCGAAAATTATTAATATTTTAATTAAAATTAGCAACGACCGAAA...

XM_057920664.1
AAGCAATATTCCTCATGGCCAATCCTACTTACTCCATACAATCTTCCTCCTTGGATGTGCATGAGAGAACAACACATATTTCTCACTGCTGTCGTCCCTGGGCCACACAATCCAAAGGATATGATTGATGTTTTTCTTCAACCGTTGATTGCTGAGTTATCTCATCTTTGGGAAGTGGGTGTCCAAGCGTATGACATATCATTGAAGAATAATTTCCAAATGCGTGCTGCACTTTTGTGGACAATTAGTGACTTTCCCGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130995395
ATGTGCATGAGAGAACAACACATATTTCTCACTGCTGTCGTCCCTGGGCCACACAATCCAAAGGATATGATTGATGTTTTTCTTCAACCGTTGATTGCTGAGTTATCTCATCTTTGGGAAGTGGGTGTCCAAGCGTATGACATATCATTGAAGAATAATTTCCAAATGCGTGCTGCACTTTTGTGGACAATTAGTGACTTTCCCGCTTATTCTATGCTTTCTGGTTGGAGTACAGCTGGTAGATTGGCATGTCCACGTTG...

LOC130995395
ATGGATGCTTCTACTCAATCCGGGTCTAATCCATCCGGTTCTACTCCATCTGGTTCGGGTCCATCCGGTTCTACTCCATCTGGTTCGGGTCCATCCGGTTCTGGTCCTATTTTCGATAATAGGCCGCCAGTGGATGAAAACCCTAATGTGGAGGAGGAACGTGTTGCTAGTGATGGGCGGACATGGGTTTATTTCACTCGTAGTATTCTGAGGCCGACTGGAGCTATTCGGGCTAGGGCGACTGATAGCTTTCAAGGTAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057776647.1
MCMREQHIFLTAVVPGPHNPKDMIDVFLQPLIAELSHLWEVGVQAYDISLKNNFQMRAALLWTISDFPAYSMLSGWSTAGRLACPRCCDDTDSFRLPLSGKQSWFDCHRRFLPTDHPFRRNKYAFIKNAQVRKGPPQTKNGYQLLAEIEGLGIKKVTELTVEETRLRISKRQRTYESGWRKKSIFWDLPYWSSLLIRHNLDVMHIEKNVFDNLFNTIMNTKGKTKDTAKSREELNRFCRRPELEANEQTGKYPKACYMLD...

XP_057776648.1
MDASTQSGSNPSGSTPSGSGPSGSTPSGSGPSGSGPIFDNRPPVDENPNVEEERVASDGRTWVYFTRSILRPTGAIRARATDSFQGMPHESGTNWKNLTEGMRDFYFDEFEKAFCWDKTQHTRHVIKKAWVKSARVAYKDYISNCKKVLLIHKKKIEYLQPNIEAAWRAYWALPDTQARSAQASRNRRSEPGGPGTGMAIHHGGSRSALDHAEHLARESNISFDEATWATFRRMHYKNGQYTAGRPAQHGLEVERRLAEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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