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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001725`

染色体: Chr07 坐标: 14690913-14692552 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001725`
名称	SmilChr07G001725
描述	uncharacterized SmilChr07G001725
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	14690913 - 14692552 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995415`
GeneID	`130995415`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995415`
原始查询	`SmilChr07G001725`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsRFPV-1; symbol=OsRFPV-1; hit=Os01g0303600; species=rice; confidence=medium
产物	OsRFPV-1; symbol=OsRFPV-1; hit=Os01g0303600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G02610` (AT1G02610) RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837915] identity=43.1; qcov=1.06; evalue=9.53e-47; confidence=medium
Rice	`Os01g0303600` (OsRFPV-1) - identity=45.4; qcov=0.935; evalue=8.02e-47; confidence=medium
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0016020 (membrane); GO:0016567 (protein ubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF12428 (DUF3675); PF12906 (RINGv)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995415

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057776669.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057776669.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057776669.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057776669.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057776669.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:14691561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B17,C18
`Chr7:14692007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:14692048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C16
`Chr7:14692162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B129,B7,D7
`Chr7:14692163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776669.1

184 aa

184

RINGv

DUF3675

PF12906 RINGv 16-60 aa PF12428 DUF3675 66-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776669.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	16	60	4.3e-13	49.9	RING-variant domain
`XP_057776669.1`	Pfam	`PF12428`	DUF3675	Family	66	164	2e-16	61.3	Protein of unknown function (DUF3675)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920686.1
CTAAAACAGAAATGATGAGTGATGCTGTATTATTGATAGATGATGACTACAGATGTTGTAGAATATGCCATGAACACGATTTCCAAATCTTGGAATCGCCTTGTCATTGTTCTGGAACACTCAAGTTTGCGCACAGAGATTGCATACAGAGATGGTGTGATGAAAAGGGCAATACTACTTGTGAAATTTGCTTACAGAAATTTAAACCTGGTTACACTGCTCCAGCCAAGAAGCTGCACACAGCAGCAACCATAAGTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995415
ATGATGAGTGATGCTGTATTATTGATAGATGATGACTACAGATGTTGTAGAATATGCCATGAACACGATTTCCAAATCTTGGAATCGCCTTGTCATTGTTCTGGAACACTCAAGTTTGCGCACAGAGATTGCATACAGAGATGGTGTGATGAAAAGGGCAATACTACTTGTGAAATTTGCTTACAGAAATTTAAACCTGGTTACACTGCTCCAGCCAAGAAGCTGCACACAGCAGCAACCATAAGTTTGTTTGTTGCAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776669.1
MMSDAVLLIDDDYRCCRICHEHDFQILESPCHCSGTLKFAHRDCIQRWCDEKGNTTCEICLQKFKPGYTAPAKKLHTAATISLFVAINEPEMESTEEILESDCTRCISAVEIRWLALVFTILLLAKNLLDIISGGSQGYPFSLVTVFIVRATGIIVPIYILFRITAAIHNSINNSVSQPIHSEV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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