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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001728`

染色体: Chr07 坐标: 14717107-14717705 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001728`
名称	SmilChr07G001728
描述	bZIP transcription factor 53
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	14717107 - 14717705 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995417`
GeneID	`130995417`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995417`
原始查询	`SmilChr07G001728`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	bZIP transcription factor 53
产物	bZIP transcription factor 53
Arabidopsis	`AT3G62420` (BZIP53) basic region/leucine zipper motif 53 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825415] identity=53.4; qcov=1.06; evalue=6.94e-51; confidence=high
Rice	`Os12g0560900` (OsOBF1) - identity=48.1; qcov=0.935; evalue=9.12e-33; confidence=medium
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00170 (bZIP_1); PF07716 (bZIP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995417

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776672.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776672.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776672.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776672.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057776672.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:14717321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B128,C50
`Chr7:14717367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:14717415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr7:14717422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:14717491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776672.1

138 aa

138

bZIP_2

bZIP_1

PF07716 bZIP_2 15-63 aa PF00170 bZIP_1 17-65 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776672.1`	Pfam	`PF07716`	bZIP_2	Coiled-coil	15	63	2.6e-06	28.1	Basic region leucine zipper
`XP_057776672.1`	Pfam	`PF00170`	bZIP_1	Coiled-coil	17	65	7.5e-09	36.3	bZIP transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920689.1
ATGGCTTCAAAACAATTGCCAACGAGCCCCGGCTCTGATTGTGATGAAAGGAAGAGGAAGCGGAAGCTGTCTAATCGTGAATCAGCGCGTAGGTCTCGGATGAAGAAGCAGCAACGCTTGGATGAGCTGATTGGAGAGGAGGGCCGGATAAAGGAGGAGAACAAGAAGCTGAGTCAGATGATTGATACTACTGCTCAGCTGCACTTAAACGTTGCGTCCAACAATAATGTGCTGAGGGCTCAGATTGCTGAACTCACTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995417
ATGGCTTCAAAACAATTGCCAACGAGCCCCGGCTCTGATTGTGATGAAAGGAAGAGGAAGCGGAAGCTGTCTAATCGTGAATCAGCGCGTAGGTCTCGGATGAAGAAGCAGCAACGCTTGGATGAGCTGATTGGAGAGGAGGGCCGGATAAAGGAGGAGAACAAGAAGCTGAGTCAGATGATTGATACTACTGCTCAGCTGCACTTAAACGTTGCGTCCAACAATAATGTGCTGAGGGCTCAGATTGCTGAACTCACTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776672.1
MASKQLPTSPGSDCDERKRKRKLSNRESARRSRMKKQQRLDELIGEEGRIKEENKKLSQMIDTTAQLHLNVASNNNVLRAQIAELTDRLRSLNSVLQIASEVSGLVIDIPDIPDALLEPWQLPCPIQSAPASVDMFQC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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