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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001733`

染色体: Chr07 坐标: 14727904-14731737 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001733`
名称	SmilChr07G001733
描述	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	14727904 - 14731737 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995420`
GeneID	`130995420`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995420`
原始查询	`SmilChr07G001733`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic
产物	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G02560` (CLPP5) nuclear encoded CLP protease 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839433] identity=82.1; qcov=1.01; evalue=8.55e-177; confidence=high
Rice	`Os03g0308100` (OsClpP5) - identity=84.4; qcov=0.752; evalue=4.78e-141; confidence=high
GO	GO:0004176 (ATP-dependent peptidase activity); GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006515 (protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins); GO:0009368 (endopeptidase Clp complex); GO:0051117 (ATPase binding)
KEGG	-
Pfam	PF00574 (CLP_protease)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995420

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057776675.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057776675.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776675.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776675.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776675.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:14728120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:14729992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr7:14729996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B118,C35,C52
`Chr7:14730000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B4,B52,C28,C41
`Chr7:14730001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:14730009`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A13,B118,B27,B60,C35,C52
`Chr7:14730033`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	111	A16,A25,A6,A7,A8,A9,B101,B102,B105,B106,B109,B11,B110,B111,B114,B115,B120,B123,B124,B127,B128,B13,B131,B134,B136,B137,B139,B14,B140,B15,B17,B18,B20,B22,B24,B3,B34,B35,B38,B39,B41,B44,B46,B5,B50,B51,B52,B54,B57,B6,B60,B61,B64,B67,B71,B73,B75,B76,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B9,B97,B98,C1,C10,C11,C12,C15,C18,C2,C20,C21,C24,C25,C26,C29,C3,C30,C35,C44,C47,C49,C5,C50,C54,C56,C58,C59,C6,C60,C62,C69,C70,C72,C79,C80,C82,C83,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D3,D5,D6
`Chr7:14730167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B51,B52,C10,C59,C87
`Chr7:14730564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B108,B46
`Chr7:14730587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr7:14730775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B52,B98,C55,D11
`Chr7:14731341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776675.1

298 aa

149

298

CLP_protease

PF00574 CLP_protease 107-283 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776675.1`	Pfam	`PF00574`	CLP_protease	Domain	107	283	1.4e-80	270.2	Clp protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920692.1
TTTTTTTTCATATACTTATTTCGAAAAAAATATTAGAAAACAGAAATCGAAAAAAAATAAACAAATAGTAGTATGATTTTTGAGTGAAAAAAATTTATCGATATTCAATTCAAATTTATCACTTTTTTTTGTCTTCGGAAAATATGATTTTTGAGGAATATCGAAATGAGAGATTTTAACGCGAAGGTTTTGGAAGAAATATTAATTGGACTCTCCTCCGAAAAAGAAATAAAAAAATACTAAGACAGAAAAGGAGGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995420
ATGGCGCATTCATGCGTCTCGTCTTCTTCTCTCAGATTCAACACGTCCTCGCTTTCTCTCTCTTCACCAAACCCATTTTCTTCCTCTTCTTCCTCCGCCAAAATCGTATCTCTTCCCTTCCAACCCCTCCGTTCCAGGAAGCTGAAGAATTCTAACCTCCGGAGTTCGCCGGCGAAGGCTATGTACACTCCAGAGTTTTATGCCCCGGAGAGGAACTCACGCCATGGTATTTGGTCGATTAGGGATGATTTACATATCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776675.1
MAHSCVSSSSLRFNTSSLSLSSPNPFSSSSSSAKIVSLPFQPLRSRKLKNSNLRSSPAKAMYTPEFYAPERNSRHGIWSIRDDLHIPSSPYFPAYAQGGQGPPPMVQERFMSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPTKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSGGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLAYHTGQSLEKINQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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