当前解析结果
SmilChr07G001738| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001738 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001738 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001738 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 14760000 - 14761337 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995425 |
|---|---|
| GeneID | 130995425 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995425 |
| 原始查询 | SmilChr07G001738 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os01g0252600; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os01g0252600; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT4G01935 (AT4G01935)insulin-induced protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828195] identity=61.3; qcov=0.873; evalue=2.72e-58; confidence=high |
| Rice | Os01g0252600- identity=60.7; qcov=0.955; evalue=1.35e-59; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995425 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057776682.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057776682.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 0.40000 | XP_057776683.1 |
| 4 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057776682.1 |
| 5 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.20000 | XP_057776683.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:14760185 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B52 |
Chr7:14760215 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B42,B43 |
Chr7:14760267 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | A18,B35 |
Chr7:14760267 |
T |
TC |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | A18,B35 |
Chr7:14760673 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B38,B39 |
Chr7:14760818 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr7:14760978 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B69 |
Chr7:14761056 |
AAG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 9 | A19,B100,B113,B132,B3,B97,C15,C61,C64 |
Chr7:14761116 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A16,B106,B26,C45,D10 |
Chr7:14761120 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B69 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。