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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001755`

染色体: Chr07 坐标: 14870304-14876178 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001755`
名称	SmilChr07G001755
描述	uncharacterized SmilChr07G001755
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	14870304 - 14876178 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995441`
GeneID	`130995441`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995441`
原始查询	`SmilChr07G001755`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	embryo defective 1379 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832240]; symbol=emb1379; hit=AT5G21140; species=arabidopsis; confidence=high
产物	embryo defective 1379 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832240]; symbol=emb1379; hit=AT5G21140; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G21140` (emb1379) embryo defective 1379 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832240] identity=56.2; qcov=0.994; evalue=9.72e-117; confidence=high
Rice	`Os12g0127100` - identity=55.6; qcov=0.909; evalue=9.35e-113; confidence=high
GO	GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination); GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006301 (DNA damage tolerance); GO:0030915 (Smc5-Smc6 complex)
KEGG	-
Pfam	PF07574 (SMC_Nse1); PF08746 (zf-RING-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995441

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776704.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057776704.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057776704.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776704.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776704.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:14874549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B52,B8
`Chr7:14874597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:14874605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B86,C71,C76
`Chr7:14874635`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A1,A14,A16,B100,B101,B109,B129,B130,B134,B18,B27,B38,B5,B53,B57,B59,B67,B77,C21,C22,C46,C58,C59,C84
`Chr7:14874638`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A1,A14,A16,B100,B101,B109,B129,B130,B134,B18,B27,B38,B5,B53,B59,B67,B77,C21,C22,C46,C58,C59,C84
`Chr7:14874642`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	A1,A14,A16,B100,B101,B109,B129,B130,B134,B18,B27,B38,B5,B53,B59,B67,B77,C21,C22,C46,C58,C59,C84
`Chr7:14874647`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	23	A1,A14,A16,B100,B101,B109,B129,B130,B134,B18,B27,B38,B5,B53,B59,B67,B77,C21,C22,C46,C58,C59,C84
`Chr7:14875712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,D6
`Chr7:14875737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:14875791`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr7:14875791`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C82
`Chr7:14875849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776704.1

317 aa

158

317

SMC_Nse1

zf-RING-like

PF07574 SMC_Nse1 8-194 aa PF08746 zf-RING-like 206-249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776704.1`	Pfam	`PF07574`	SMC_Nse1	Family	8	194	4.9e-48	164.3	Nse1 non-SMC component of SMC5-6 complex
`XP_057776704.1`	Pfam	`PF08746`	zf-RING-like	Domain	206	249	8.4e-11	42.5	RING-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920721.1
GCGGGCACTAACCATTTTCCCGCCAATTAAAGCACAATTGCCTCCCTCCTCGACCTCCACCTATTTTCTTCCCCAAGCGGAGAAGCCTTCTTCTTTGCTCATAGTTGGACAAAATAAAATGGCACCGCTCAGTTCGCGGCACCACACCCTAATACAGGCTCTTTTGTCGCGAGGCCCGCTTAAAGAAGACGATTTCCGCTCTATCTTCTCGCAGATCACTGCTAAAAACTCTGGGTCACGGAAGCAACAGGAGCAAAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995441
ATGGCACCGCTCAGTTCGCGGCACCACACCCTAATACAGGCTCTTTTGTCGCGAGGCCCGCTTAAAGAAGACGATTTCCGCTCTATCTTCTCGCAGATCACTGCTAAAAACTCTGGGTCACGGAAGCAACAGGAGCAAAAGTTATTTAATGAGTATCTCGGGAAGATAAATTCAGAATTAAGTTGTGTTCAGTTAGAGTTGCGAGCATGCCGAAACCAATATGATGGTCATGTGTATTATGGTGTTGTCAACAATGTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776704.1
MAPLSSRHHTLIQALLSRGPLKEDDFRSIFSQITAKNSGSRKQQEQKLFNEYLGKINSELSCVQLELRACRNQYDGHVYYGVVNNVSDDQSKLGTKYTVPQIAFYKGIVEAIVQDAEAEGCIFNTAALNIKLESQVLGATDSQAHEGAVQIPPAFKNFSMAQKEKTLDQLVKDNWLCSTPEGKIGIGVRSFLDLRSWFRSNEVPACEVCNEAAIKAQLCQNEACNVRLHSYCLKKKFSGQRVERVCSGCGTQLPGSTVKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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