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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001756`

染色体: Chr07 坐标: 14879197-14883102 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001756`
名称	SmilChr07G001756
描述	uncharacterized SmilChr07G001756
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	14879197 - 14883102 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995442`
GeneID	`130995442`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995442`
原始查询	`SmilChr07G001756`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822080]; symbol=AT3G24820; hit=AT3G24820; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822080]; symbol=AT3G24820; hit=AT3G24820; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G24820` (AT3G24820) BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822080] identity=44.6; qcov=0.979; evalue=9.26e-46; confidence=medium
Rice	`Os02g0726400` - identity=53.7; qcov=0.5; evalue=7.87e-32; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03909 (BSD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995442

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057776705.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057776705.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057776705.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776705.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776705.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:14879262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,C39,C4
`Chr7:14879399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:14880848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:14882218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:14882267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B53,B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776705.1

190 aa

190

BSD

PF03909 BSD 93-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776705.1`	Pfam	`PF03909`	BSD	Domain	93	143	3.4e-12	46.9	BSD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092151.1
AAAATATACGGCCCAATTCTCATTGTAAATTGCAGAGACTGATGCCTCGCTGAGTTGCGGCCATGGATGCATACACATGGTTCCGGCGAAGTGTTTCTAAGCTGAAAAGGACGTCCTTGCCCTCTATCGCGGCCGCCACCACCGCAACCGCGACTGCCAATGCTAGCAAGAGTTCCGAAAACAAATTAGACCAACAAGAAGAGGATAAATTTTATGGAATCACTGAGCAATTAATAGAATTGGTCAAATCATTCTCTCTC...

XR_009092150.1
AAAATATACGGCCCAATTCTCATTGTAAATTGCAGAGACTGATGCCTCGCTGAGTTGCGGCCATGGATGCATACACATGGTTCCGGCGAAGTGTTTCTAAGCTGAAAAGGACGTCCTTGCCCTCTATCGCGGCCGCCACCACCGCAACCGCGACTGCCAATGCTAGCAAGAGTTCCGAAAACAAATTAGACCAACAAGAAGAGGATAAATTTTATGGAATCACTGAGCAATTAATAGAATTGGTCAAATCATTCTCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995442
ATGGATGCATACACATGGTTCCGGCGAAGTGTTTCTAAGCTGAAAAGGACGTCCTTGCCCTCTATCGCGGCCGCCACCACCGCAACCGCGACTGCCAATGCTAGCAAGAGTTCCGAAAACAAATTAGACCAACAAGAAGAGGATAAATTTTATGGAATCACTGAGCAATTAATAGAATTGGTCAAATCATTCTCTCTCGACACCTTCAGGAACTTCGTTCTTCCTGATGAGGAAGAAAGTGGCTGTGATGTTGGAAACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776705.1
MDAYTWFRRSVSKLKRTSLPSIAAATTATATANASKSSENKLDQQEEDKFYGITEQLIELVKSFSLDTFRNFVLPDEEESGCDVGNSGNVQMDLSDWQETHAMLVLSRVKELAQLRFRLCPRYLKEKQFWRIYFTLVRSFVVEYELHAVRVARLKQIRSGSETASNSSACEVEMSEAKTISSLDSATSME

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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