当前解析结果
SmilChr07G001761| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001761 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001761 |
| 描述 | eIF-2-alpha kinase GCN2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 14910093 - 14911862 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995448 |
|---|---|
| GeneID | 130995448 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995448 |
| 原始查询 | SmilChr07G001761 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | eIF-2-alpha kinase GCN2-like |
| 产物 | eIF-2-alpha kinase GCN2-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995448 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057776712.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057776712.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057776712.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057776712.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057776712.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:14911104 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B108,B131 |
Chr7:14911124 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B66,B68,B72,B94,C82 |
Chr7:14911124 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | B66,B68,B72,B94,C82 |
Chr7:14911134 |
T |
TAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 16 | A14,A18,A20,B10,B103,B130,B17,B36,B48,B80,C12,C13,C19,C33,C73,D1 |
Chr7:14911328 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 68 | A1,A21,A23,A7,B102,B107,B117,B119,B123,B125,B127,B128,B129,B134,B136,B139,B14,B16,B2,B21,B27,B29,B3,B35,B4,B41,B44,B5,B51,B52,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B65,B66,B7,B73,B74,B76,B79,B8,B85,B86,B90,B92,C15,C17,C18,C2,C20,C21,C22,C31,C32,C34,C47,C61,C67,C68,C7,C77,C81,C84,C9,D6 |
Chr7:14911360 |
C |
CAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B112,B115,B93,C70 |
Chr7:14911360 |
C |
CAT |
2bp_insertion | CDS_variant | 4 | B112,B115,B93,C70 |
Chr7:14911362 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 11 | A15,A4,B117,B136,B34,B4,B49,B79,C18,C20,C36 |
Chr7:14911366 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,B55 |
Chr7:14911653 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B115 |
Chr7:14911653 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B115 |
Chr7:14911679 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,B55 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
6 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。