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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001770`

染色体: Chr07 坐标: 14990663-14993853 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001770`
名称	SmilChr07G001770
描述	uncharacterized SmilChr07G001770
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	14990663 - 14993853 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995457`
GeneID	`130995457`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995457`
原始查询	`SmilChr07G001770`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Alba DNA/RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768790]; symbol=AT3G07030; hit=AT3G07030; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Alba DNA/RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768790]; symbol=AT3G07030; hit=AT3G07030; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G07030` (AT3G07030) Alba DNA/RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768790] identity=70.2; qcov=0.579; evalue=3.37e-73; confidence=medium
Rice	`Os03g0166000` - identity=74.1; qcov=0.486; evalue=1.98e-65; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01918 (Alba); PF12328 (Rpp20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995457

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057776723.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057776723.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057776723.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057776723.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776723.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:14990935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,C11,C13,C69
`Chr7:14990977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr7:14990978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr7:14991213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr7:14991338`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	37	A11,A13,A2,A20,A9,B104,B106,B109,B120,B19,B25,B28,B35,B37,B38,B39,B40,B52,B63,B72,B84,B98,B99,C11,C45,C49,C52,C55,C6,C64,C66,C69,C71,C75,C78,D11,D7
`Chr7:14991461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B93,C23,C8,C83
`Chr7:14991667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,D10
`Chr7:14991677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr7:14992291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C25
`Chr7:14992318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:14993637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776723.1

278 aa

139

278

Alba

Rpp20

PF01918 Alba 19-82 aa PF12328 Rpp20 41-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776723.1`	Pfam	`PF01918`	Alba	Domain	19	82	1.8e-15	57.1	Alba
`XP_057776723.1`	Pfam	`PF12328`	Rpp20	Family	41	110	2.1e-08	34.8	Rpp20 subunit of nuclear RNase MRP and P

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920740.1
ATACTCCGTTCCATTTCCATACATCACATCACGCCCACAACATTTCCCCGCCTCTCTGTCTCACTCTTTCTCTCTCTCTAGGGTTTTTAGGGTTTGAGGGAAAATGGATAGATACCAAAAGGTGGAGAAGCCGAAGCCTGAATCTCCTGTTAACGAGAATGAGATCCGTATCACGTCTCAAGGCCTCGTTCGTAACTACCTCAGCTACGCCACCACCCTTCTTCAGGAGAGACAAGTGAAAGAGATTGTCTTAAAGGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995457
ATGGATAGATACCAAAAGGTGGAGAAGCCGAAGCCTGAATCTCCTGTTAACGAGAATGAGATCCGTATCACGTCTCAAGGCCTCGTTCGTAACTACCTCAGCTACGCCACCACCCTTCTTCAGGAGAGACAAGTGAAAGAGATTGTCTTAAAGGCAATGGGCCAGGCTATAAACAAAACTGTGGCTATTGCAGAAATCATTAAGAGAAGAGTTCCTCGACTGCATCAGGACACTGCCATCAGCTCAGTCAGCATAACTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776723.1
MDRYQKVEKPKPESPVNENEIRITSQGLVRNYLSYATTLLQERQVKEIVLKAMGQAINKTVAIAEIIKRRVPRLHQDTAISSVSITDTFEPIEEGLQIVEQTRHVSMISITLSTKELNQNSPGYQGPSNADQTKQQYNNYQPQQQQQQQPPPRQARAIYNAGNGDTYGRGRGRGRGRGRGWHRGGYSNYQENGGYSGGYSGGYSNSGGYSGGYSGGYSNSGGYSNWGRGGGRGGWGGGYRGAGYGRGRGRGGGGRGYGGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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