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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001772`

染色体: Chr07 坐标: 15015069-15023070 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001772`
名称	SmilChr07G001772
描述	uncharacterized SmilChr07G001772
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	15015069 - 15023070 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995460`
GeneID	`130995460`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995460`
原始查询	`SmilChr07G001772`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0594300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0594300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G04700` (AT1G04700) PB1 domain-containing protein tyrosine kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839437] identity=81.7; qcov=0.255; evalue=1.63e-171; confidence=weak
Rice	`Os12g0594300` - identity=74; qcov=0.301; evalue=5.59e-177; confidence=low
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00564 (PB1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995460

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057776726.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057776726.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057776726.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776726.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776726.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:15015988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr7:15016036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr7:15016207`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B100
`Chr7:15016207`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B100
`Chr7:15016218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr7:15016538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:15016636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C13,C69
`Chr7:15016786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr7:15017158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr7:15017232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr7:15017247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr7:15017652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B128,B34,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776726.1

1176 aa

588

1176

PB1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00564 PB1 208-290 aa PF00069 Pkinase 898-1156 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 899-1158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776726.1`	Pfam	`PF00564`	PB1	Domain	208	290	7.5e-21	74.6	PB1 domain
`XP_057776726.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	898	1156	3.4e-47	161.8	Protein kinase domain
`XP_057776726.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	899	1158	4.7e-63	213.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920743.1
TCAAAAGTGTAACATTGAAGTCCAGCTTAAGTTAGCCTACCGAAGGATCCGATCATATATCGGGTCGGGTTTGAGGTCGCCTTAAATTATCGGAAATGCAGCTCCGGCGCCCCAGTAATTGAAAACTAAGTACTGTACACACAAGCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAACTCCCCCCTCCCCTCTCTCTCCTTTCTGGTGATCCAATATTAAACTACCGCGCACAATCTTATCCATTCCCCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995460
ATGCAACAGCTAAATAGGTCTACTGACATTGCTGAAGCCATGACTGGCGGGCCGCCTGGCATCAATAGTCATTGTGCTCAGCAAGTTTCATTGGACACTTTACCCAGAAATGGTCCGCCAATAAAGAAACAAGTAAATAATATATCTATTCAGACTGGAGAGGAGTTCTCCATGAAATTTCTTCAAGAATGTGCTGCTTCTAGAGTTATTACTGAAGCGCCTGGTGTCACTCCCAGCTATGAGGAGAATGTCGGTTTTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776726.1
MQQLNRSTDIAEAMTGGPPGINSHCAQQVSLDTLPRNGPPIKKQVNNISIQTGEEFSMKFLQECAASRVITEAPGVTPSYEENVGFPDVQDRQMVYEELARVLGLARMDSECGSDITEYASAKGSTSQIDAGVHVSNESLHYMNISANGHKPSKSTSEVCNDEASLVSTVPLLSQSDSSRSLCSDGSQSGKLKILCSFGGKILPRPSDGKLRYVGGETRIISISKNPSWEELMKKIAGMCNQPYSIKYQLPGEDLDALIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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