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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001773`

染色体: Chr07 坐标: 15027356-15032190 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001773`
名称	SmilChr07G001773
描述	3-ketoacyl CoA thiolase 1, peroxisomal-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	15027356 - 15032190 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995461`
GeneID	`130995461`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995461`
原始查询	`SmilChr07G001773`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3-ketoacyl CoA thiolase 1, peroxisomal-like
产物	3-ketoacyl CoA thiolase 1%2C peroxisomal-like
Arabidopsis	`AT2G33150` (PKT3) peroxisomal 3-ketoacyl-CoA thiolase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817876] identity=77.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0457600` - identity=75.9; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003988 (acetyl-CoA C-acyltransferase activity); GO:0005777 (peroxisome); GO:0006635 (fatty acid beta-oxidation); GO:0010124 (phenylacetate catabolic process)
KEGG	smil00071 (Fatty acid degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00280 (Valine, leucine and isoleucine degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00592 (alpha-Linolenic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01040 (Biosynthesis of unsaturated fatty acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01212 (Fatty acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00108 (Thiolase_N); PF02803 (Thiolase_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995461

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057776727.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057776727.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057776727.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776727.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776727.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:15029597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B118
`Chr7:15029973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B118
`Chr7:15030133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr7:15030924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B7,D6
`Chr7:15031706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:15031760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr7:15031901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B23,B7,D6
`Chr7:15031911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C16
`Chr7:15031931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776727.1

462 aa

231

462

Thiolase_N

Thiolase_C

PF00108 Thiolase_N 52-307 aa PF02803 Thiolase_C 315-438 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776727.1`	Pfam	`PF00108`	Thiolase_N	Domain	52	307	3.9e-76	256.6	Thiolase, N-terminal domain
`XP_057776727.1`	Pfam	`PF02803`	Thiolase_C	Domain	315	438	3e-48	163.2	Thiolase, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920744.1
AAGGAGAGTTTTTATTATAATTTATAATCAATCCCTATTAATATACTCCATCTCCATCTCATATAGATAAAGTATTCGTGAAAAACGTGAAACAAAGTTACTGAGAAATTTAATTGCAATTAGCGTTTGAATTCCACCGTCCACGACCACCACACAATCTGCTAAACTTCCTCAACTAGCACTAGCAGTCCTTGCGCCTCTGTTTCCCTTAAATTAACCACCATTTCATTTCTTCAAGTCAACAACTCTGAGAGAGAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995461
ATGGAGAAAGCAATCAACAGACAGAGAGTTCTGCTGGAGCATTTGCGACCCACTTCCTTTTCTCGCCATAACCCTCAATCTTCTCTCTCCCATTCCATATGTTCGGCGGGGGATGGTGGTGCCTATCAAAGAACAACGGCTTTCGGAGATGACATTGTTATCGTTGCAGCTTATCGAACTGCCATATGCAAAGCTAAGCGAGGGGGGTTCAAGGATACCCTTCCAGATGATTTGCTTGCCACTGTACTAAAAGCGTTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776727.1
MEKAINRQRVLLEHLRPTSFSRHNPQSSLSHSICSAGDGGAYQRTTAFGDDIVIVAAYRTAICKAKRGGFKDTLPDDLLATVLKALIERTNLNPAEVGDIVVGTVLAPGSLRAIECRMAAFYAGFPDSVPLRTVNRQCSSGLQAVADVAAFIKAGYYDIGIAAGLESMSVDNVDRFKSDNPKKESFIQARDCLLPMGITSENVAERFGVTREEQDQAAVVSHQRAAAARAAGKFKDEIVPVSTKIVDPKTGEAKPVIISV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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