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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001787`

染色体: Chr07 坐标: 15205233-15207550 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001787`
名称	SmilChr07G001787
描述	non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	15205233 - 15207550 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995474`
GeneID	`130995474`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995474`
原始查询	`SmilChr07G001787`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A-like
产物	non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A-like
Arabidopsis	`AT1G51130` (AT1G51130) Nse4, component of Smc5/6 DNA repair complex [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841536] identity=48.4; qcov=0.814; evalue=4.79e-89; confidence=high
Rice	`Os06g0618000` - identity=49.5; qcov=0.82; evalue=1.16e-91; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006281 (DNA repair); GO:0030915 (Smc5-Smc6 complex)
KEGG	-
Pfam	PF08743 (Nse4_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995474

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776747.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057776747.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776747.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776747.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057776747.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:15205505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B72,B77,B78
`Chr7:15205544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B125
`Chr7:15205546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C82
`Chr7:15205713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B84,C27,C71
`Chr7:15205851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C82
`Chr7:15205869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,C23,C8
`Chr7:15205929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B125
`Chr7:15205983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B79,C36
`Chr7:15206025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr7:15207392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776747.1

345 aa

172

345

Nse4_C

PF08743 Nse4_C 209-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776747.1`	Pfam	`PF08743`	Nse4_C	Domain	209	291	1.4e-21	77.2	Nse4 C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920764.1
GCACTTACTAAACTCTTCATATTCTGGCCCAAGGCTTCCACGCTACGCCAAACACCAAGAGCGATGGAGACGGAGACCGCCCTTGCAATTCTTAAGGAAGAAGAAAATACTCATCCCAATCTTTCCGGTTCCAAACGTAGGGAACTTCGTTCATGCTACCGTGAAATCGAAAGATGCATTAACGAGGGGAAAGATGATATTGCAGATGCGACTTCCAAAAAGTTCATGGCCATCATGAACGAAGTGGAAAACATCCATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995474
ATGGAGACGGAGACCGCCCTTGCAATTCTTAAGGAAGAAGAAAATACTCATCCCAATCTTTCCGGTTCCAAACGTAGGGAACTTCGTTCATGCTACCGTGAAATCGAAAGATGCATTAACGAGGGGAAAGATGATATTGCAGATGCGACTTCCAAAAAGTTCATGGCCATCATGAACGAAGTGGAAAACATCCATCAACATGTAAGCAAGCCGCGAGAGCAGGTAGCAGATGCAGAAGCCTTCTTAGGGCTGACCAGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776747.1
METETALAILKEEENTHPNLSGSKRRELRSCYREIERCINEGKDDIADATSKKFMAIMNEVENIHQHVSKPREQVADAEAFLGLTSILVDSVRSHSKAGVTPVEFVSCLIREFGQVKRQKENSYNVSWQDIGYCVSPIFKSGSGCRTMIGPMKNELKPRKRVVRAKRARPMKKTIPEELETTVDLVSNTDRNIHVMFEVLKRKKKAEVECLVLNRYSFAQTVENLFALSFLVKDGRVHMYVDETGARLVVPRNGPSAEEI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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