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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001789`

染色体: Chr07 坐标: 15232689-15235507 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001789`
名称	SmilChr07G001789
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	15232689 - 15235507 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995476`
GeneID	`130995476`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995476`
原始查询	`SmilChr07G001789`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK1
产物	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK1
Arabidopsis	`AT5G24080` (AT5G24080) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832473] identity=32.5; qcov=1.03; evalue=8.71e-116; confidence=low
Rice	`Os04g0475200` - identity=46; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF01453 (B_lectin); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995476

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057776756.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776756.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776756.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776756.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776756.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:15232846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B18,B47,B73,C54
`Chr7:15232877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B53
`Chr7:15232998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C60
`Chr7:15233108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C60
`Chr7:15233198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:15233245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B132,B20
`Chr7:15233303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B20
`Chr7:15233329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:15233363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B79,C13,C69
`Chr7:15233768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	118	A11,A13,A14,A2,A23,A25,A4,A5,A6,A8,B10,B100,B101,B102,B105,B109,B111,B112,B113,B115,B120,B122,B124,B125,B129,B13,B131,B132,B134,B135,B137,B15,B19,B24,B26,B27,B3,B30,B32,B36,B37,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B45,B48,B54,B56,B59,B60,B62,B63,B64,B67,B70,B72,B76,B78,B81,B82,B84,B86,B88,B89,B9,B91,B93,B96,B97,C1,C10,C12,C15,C19,C22,C25,C27,C3,C31,C32,C33,C38,C4,C40,C43,C46,C49,C51,C52,C53,C55,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C68,C70,C72,C74,C76,C79,C80,C83,C84,C85,C86,C87,D10,D2,D5,D7,D9
`Chr7:15234117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr7:15234302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776756.1

795 aa

398

795

B_lectin

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF01453 B_lectin 78-158 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 509-778 aa PF00069 Pkinase 510-776 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776756.1`	Pfam	`PF01453`	B_lectin	Repeat	78	158	1.4e-16	61.6	D-mannose binding lectin
`XP_057776756.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	509	778	9.3e-50	170.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057776756.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	510	776	3.9e-51	174.7	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920773.1
ACAATAATAGCTTTTTCTACATTCAATGCAAATTTGTGTTGAAAATTGCAATTCAATTAATCTACAAAGACAGTAAACTAAATACTTAAAAATGTAAAATAGACTCGTATGGGAGAAGGACTTGTACGCGGACTCATCAAATTTTCCACACAAATTATTTTGATTTTGTATTTCTGAGACAAGGACTTGAACGACGACGTTGACTTAAGCGAAGACCCAACAAAAAGTCTTGCACGCGTTTCTCCCAAACTTCATTTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995476
ATGGCTTCACTGCCATTAATGAACATGCTGGTCATCACTGTCATGTTACTAGTGCTACCGATTCCAGCCACCGCGCAATCACGCACCAACATAACTCTGGGTTCATCCCTCGTTGCCAACGCTGCCACTTCCACTTGGCTATCGCCTTCTGCTGAATTCGCTTTCGGATTCCAACCCACAGCAGGCGGCGGCTACTTGCTGGCCATCTGGTTCCACAAAATACCTGAAAAAACAATAATCTGGTCAGCCAATCGCGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776756.1
MASLPLMNMLVITVMLLVLPIPATAQSRTNITLGSSLVANAATSTWLSPSAEFAFGFQPTAGGGYLLAIWFHKIPEKTIIWSANRDNPAPEGSTVRLAANGRLQLSDPSGRQFWAADPAAAYAALLDTGNLVLFSAASENLWQSFDQPTDTLVPSQILNQGGQLISSFSDKNYSRGRFFFAMQSDGNLVGYTRNFPMNDGIKAYLATMTVGDGFRYIFNASGYLNLVARNGTLLRNIFSNTGASTAQFYQRLTLDYDGVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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