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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001793`

染色体: Chr07 坐标: 15277976-15281212 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001793`
名称	SmilChr07G001793
描述	IRK-interacting protein-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	15277976 - 15281212 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995481`
GeneID	`130995481`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995481`
原始查询	`SmilChr07G001793`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	IRK-interacting protein-like
产物	IRK-interacting protein-like
Arabidopsis	`AT5G12900` (AT5G12900) DNA double-strand break repair RAD50 ATPase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831130] identity=52.7; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0508100` - identity=48.5; qcov=1.05; evalue=4.2e-174; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24994 (GIL1_IRKI_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995481

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057776758.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057776758.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057776758.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776758.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776758.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:15278312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B64,C16,C52
`Chr7:15278453`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	190	A1,A11,A13,A14,A16,A19,A2,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B105,B106,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B125,B129,B13,B131,B134,B135,B136,B137,B138,B15,B17,B18,B19,B2,B21,B22,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B48,B49,B50,B51,B53,B54,B55,B56,B59,B60,B61,B62,B63,B66,B67,B69,B7,B70,B72,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B91,B93,B94,B96,B97,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C18,C19,C23,C25,C26,C27,C3,C30,C31,C33,C34,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C42,C43,C44,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C69,C70,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C81,C82,C84,C85,C86,C87,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr7:15278456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr7:15278464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B64,C52
`Chr7:15278570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B64,C52
`Chr7:15278681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:15278906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,D11
`Chr7:15278981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776758.1

552 aa

276

552

GIL1_IRKI_C

PF24994 GIL1_IRKI_C 494-545 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776758.1`	Pfam	`PF24994`	GIL1_IRKI_C	Domain	494	545	2.2e-07	31.5	GIL1/IRKI C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920775.1
TCACCTCCTCTATTCTATAGTTTAGAGGAGACTATATTGTATAGAAGCGAAAATTTAAGCACTACACATTAAGAGATAGCGACGACATTTTTTAAAAAGGAAAAAGAAAAGGATAAAGAAGGCAATTTGTGACGCTTGTCATAAAAGAGGAAAAGCAAGAGAGCATTGAGTCCTCTCCTATCCTTGCATATTGGAGTTCACATGCACTCGGTTTCACTTCTACTGCGATTGAGCTAAAATCATCGCCATACCTTTCTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995481
ATGGCGGATGCGTATAGAGAATTAGAGAGCGGCAATGGCAATGGCGTTAAAGCGGCGATGGCGAAAGCGGTGGAGCTGAGGGCTCTTCATGCTGCTCTTATGCAAAGCCCCATTCCATCTGCTTCCCCTATTTCGCGTCATGCTTCACATTTATCTGCTCAAGATTACCCTGTTTTCACCCCTAGTTACGATGATGATCCACTACCAGGATACCAGCAAATCTTGCTGGACAATCGAAGTTACACGGAGAGTTGGGGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776758.1
MADAYRELESGNGNGVKAAMAKAVELRALHAALMQSPIPSASPISRHASHLSAQDYPVFTPSYDDDPLPGYQQILLDNRSYTESWGDGVGNVEDDSFVSDYTSANESSRKGVVNFEGHMHMHICPSAAADHHHFSTTNLLRSSPHQFSKSRRNSMGDMASISSSCNRCKPAVISSESEQGVTRRGGKSNIVVPLTDSHSSLHPQPRSRGLGLPSWLFPRLKKKSKNEGDGVGIGIGIVSVETLRKEVAEANESRDAAQYQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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