Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001796`

染色体: Chr07 坐标: 15306210-15315564 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001796`
名称	SmilChr07G001796
描述	methylesterase 17
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	15306210 - 15315564 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995483`
GeneID	`130995483`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995483`
原始查询	`SmilChr07G001796`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	methylesterase 17
产物	methylesterase 17
Arabidopsis	`AT3G10870` (MES17) methyl esterase 17 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820257] identity=60.4; qcov=1.01; evalue=2.43e-118; confidence=high
Rice	`Os12g0117100` - identity=53.3; qcov=0.924; evalue=6.8e-94; confidence=high
GO	GO:0009694 (jasmonic acid metabolic process); GO:0009696 (salicylic acid metabolic process); GO:0080030 (methyl indole-3-acetate esterase activity); GO:0080031 (methyl salicylate esterase activity); GO:0080032 (methyl jasmonate esterase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995483

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057776764.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057776764.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776764.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776764.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776764.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:15306438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:15314766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776764.1

276 aa

138

276

Abhydrolase_1

Hydrolase_4

Abhydrolase_6

PF00561 Abhydrolase_1 19-145 aa PF12146 Hydrolase_4 21-123 aa PF12697 Abhydrolase_6 21-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776764.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	19	145	4.9e-15	56.6	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057776764.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	21	123	5e-10	39.8	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057776764.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	21	260	4.4e-17	64.1	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920781.1
AGTGCAATGGCGTCATGTTTGGTAATAGGCACTATCAATCATACTCCATTTCTAATATTTTTTTCATCAATTCGAAATCAAACAAGAAGACCAGGCTGGAATGCTGGAACAGTTGCAAGGAGAAGAAAAAAAAAATTAGATTTTAAAATATATAATCTCATACATAAACAACATATTACATAAATAAATACTAATGTAAATAAAATAGAATCCTATAGGTTTATTATATTAGTATTATTTTCTAATTTGGAGGACGGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995483
ATGGGAGAAGACTACTCCGTTGATGCGGCCGGAATAATGAAAGAGGATGCGCCGCCTCACTTTGTGCTGATTCATGGGATAAGTGGCGGCGCGTGGTGCTGGTACAAAATCAAGTGCCTTATGGAGAATTGTGGATACAAGGTGACATGCCTTGACCTCAAAGGCGCCGGCATGGATCAAACTGACCCAAACGCCGTCGTTTCCTTTGAAGACTACAATCAGCCACTCATTGATTTCCTCTCATCCTTGCACGACCACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776764.1
MGEDYSVDAAGIMKEDAPPHFVLIHGISGGAWCWYKIKCLMENCGYKVTCLDLKGAGMDQTDPNAVVSFEDYNQPLIDFLSSLHDHQQVILVGHSAGGLSLSDAIQRFGKKKIKLAVFVAATMLKSGYLTDQDIKDGVPDLSGFGELNEVYDIGFGLGEGNPPTSTIIKRELQRKIIYNLSPQEDATLAAMLLRPGPIQALVTAKFPVAEKDEEQVARIYIKTTQDNVIKAEQQEAMIKKWAPSYVYVLESDHSPFFSAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器