当前解析结果
SmilChr07G001798| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001798 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001798 |
| 描述 | BAG family molecular chaperone regulator 7-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 15351597 - 15354558 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995485 |
|---|---|
| GeneID | 130995485 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995485 |
| 原始查询 | SmilChr07G001798 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | BAG family molecular chaperone regulator 7-like |
| 产物 | BAG family molecular chaperone regulator 7-like |
| Arabidopsis | AT5G62390 (BAG7)BCL-2-associated athano 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836360] identity=43.4; qcov=1.26; evalue=2.78e-88; confidence=medium |
| Rice | Os06g0104400 (P0644B06.3-1)- identity=40.3; qcov=0.985; evalue=4.36e-64; confidence=medium |
| GO | GO:0006457 (protein folding); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0051087 (protein-folding chaperone binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02179 (BAG); PF28661 (BAG7_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995485 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057776766.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057776766.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057776766.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057776766.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057776766.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:15351823 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,B131,B56,B96 |
Chr7:15351927 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C36 |
Chr7:15352290 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B118 |
Chr7:15352390 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B8 |
Chr7:15352474 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B30,B84 |
Chr7:15353874 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B123,B2 |
Chr7:15354258 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 20 | A7,B107,B123,B16,B44,B5,B51,B52,B6,B62,B76,B79,B86,C15,C21,C22,C47,C61,C67,D4 |
Chr7:15354261 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 14 | B100,B127,B134,B55,B61,B65,B66,B74,B90,B92,C19,C21,C34,C9 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057776766.1PF28661
BAG7_N 105-200 aa
PF02179
BAG 251-317 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057776766.1 |
Pfam | PF28661 |
BAG7_N | Domain | 105 | 200 | 9.2e-23 | 81.8 | BAG7 N-terminal domain |
XP_057776766.1 |
Pfam | PF02179 |
BAG | Family | 251 | 317 | 1.9e-05 | 25.8 | BAG domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。