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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001813`

染色体: Chr07 坐标: 15542518-15543081 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001813`
名称	SmilChr07G001813
描述	uncharacterized SmilChr07G001813
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	15542518 - 15543081 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993878`
GeneID	`130993878`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993878`
原始查询	`SmilChr07G001813`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=22.9; qcov=0.818; evalue=5.74e-10; confidence=weak
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.9; qcov=0.797; evalue=5.06e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993878

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774897.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057774897.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774897.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774897.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774897.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:15542543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr7:15542597`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B2,B57,B98,C28,C37,C43,C48,C61,C62
`Chr7:15542612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	65	A11,A13,A24,A25,B1,B102,B109,B11,B111,B112,B113,B117,B120,B125,B129,B136,B137,B140,B15,B17,B2,B34,B37,B38,B39,B40,B54,B58,B59,B63,B66,B69,B70,B73,B81,B89,B94,B97,C10,C2,C23,C27,C30,C33,C35,C36,C4,C40,C41,C46,C52,C55,C63,C64,C65,C66,C7,C72,C75,C77,C8,C81,C85,C87,D9
`Chr7:15542618`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B100,B60,B88,C79
`Chr7:15542618`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B100,B60,B88,C79
`Chr7:15542622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B60,B88,C79
`Chr7:15542623`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B100,B60,B88,C79
`Chr7:15542623`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B100,B60,B88,C79
`Chr7:15542648`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B100,B60,B88,C79
`Chr7:15542648`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B100,B60,B88,C79
`Chr7:15542655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr7:15542682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B20,B80,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774897.1

187 aa

187

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 14-83 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774897.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	14	83	3.7e-16	60.3	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918914.1
ATGAGGAACTCGAGTACGATGACTCCCAGCGACAAAGTGACGTTTGCAAAAATCTGGGCCACACATGCTCCCCATAAGGCAAAAATTACAGTTTGGAGAACATTGAGGAACAGGCTGCCCACTTGCAATAATCTCAAGAAGAGAAATATCCCTTTGGACGAGGTGGACTCTATGTGCAATGCTTGCTTCTCCCACAACGAGTCAATCAACCATGTGTTTCTTAGATGTCAGAAAACTGAAATGGTGTGGGACGAGCTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993878
ATGAGGAACTCGAGTACGATGACTCCCAGCGACAAAGTGACGTTTGCAAAAATCTGGGCCACACATGCTCCCCATAAGGCAAAAATTACAGTTTGGAGAACATTGAGGAACAGGCTGCCCACTTGCAATAATCTCAAGAAGAGAAATATCCCTTTGGACGAGGTGGACTCTATGTGCAATGCTTGCTTCTCCCACAACGAGTCAATCAACCATGTGTTTCTTAGATGTCAGAAAACTGAAATGGTGTGGGACGAGCTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774897.1
MRNSSTMTPSDKVTFAKIWATHAPHKAKITVWRTLRNRLPTCNNLKKRNIPLDEVDSMCNACFSHNESINHVFLRCQKTEMVWDELQNWLGTTTVRPNQVSTHFSTFSNLGKGKRSGKFLASMWMCTIWQLWKERNDSRFEGKQRDVKSMIAEIKTRMWSWNKIFDLLDQEQNLSLWCSQEISTRIV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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