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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001817`

染色体: Chr07 坐标: 15579749-15594141 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001817`
名称	SmilChr07G001817
描述	ATP-dependent DNA helicase SRS2-like protein At4g25120
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	15579749 - 15594141 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995504`
GeneID	`130995504`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995504`
原始查询	`SmilChr07G001817`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP-dependent DNA helicase SRS2-like protein At4g25120
产物	ATP-dependent DNA helicase SRS2-like protein At4g25120
Arabidopsis	`AT4G25120` (SRS2) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828615] identity=56; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0492100` (P0038F10.105) - identity=64.1; qcov=0.765; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000725 (recombinational repair); GO:0003677 (DNA binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0016787 (hydrolase activity); GO:0043138 (3'-5' DNA helicase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00580 (UvrD-helicase); PF13245 (AAA_19); PF13361 (UvrD_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995504

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776790.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776790.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776790.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776790.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057776790.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:15580012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:15580214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr7:15580466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B129,B2
`Chr7:15580544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr7:15580892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:15580900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C2
`Chr7:15583366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:15583997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B61
`Chr7:15584170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr7:15584430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:15584435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr7:15584459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776790.1

1187 aa

594

1187

UvrD-helicase

AAA_19

UvrD_C

PF00580 UvrD-helicase 299-579 aa PF13245 AAA_19 314-563 aa PF13361 UvrD_C 584-962 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776790.1`	Pfam	`PF00580`	UvrD-helicase	Domain	299	579	2.1e-66	225.1	UvrD/REP helicase N-terminal domain
`XP_057776790.1`	Pfam	`PF13245`	AAA_19	Domain	314	563	5e-19	69.5	AAA domain
`XP_057776790.1`	Pfam	`PF13361`	UvrD_C	Domain	584	962	3.7e-42	145.8	UvrD-like helicase C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920807.1
TTGAACTGTCCACTCCCCCAGTCCCAATTCCCCATTCCCTCTTCAGTAGTCATTTGCTGCTTCATAGGGTTTCCTTGATTTCACATTTCTTGTATCCATATACATTATCACAACTTTTCATTTCCGTGTTTATGAAGATAAAGAGATGAGCAACAAGGAGAATGCCGTGGCTGCCCCCATCAGAGGCGAATTATCGGCGGAGCAGCGCACTCGAATTTCCCAAAATTTCCGAGCCGCCAAGGCGCGCCTGTCTCGCAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995504
ATGAGCAACAAGGAGAATGCCGTGGCTGCCCCCATCAGAGGCGAATTATCGGCGGAGCAGCGCACTCGAATTTCCCAAAATTTCCGAGCCGCCAAGGCGCGCCTGTCTCGCAAACGCCCCATCTCCGACCTCACAGCTGCCTCCGATGGTCTCTCCAGCATCCTGACGTATGGGGATGAGAGAAAAACTAAATGTACAGTTGTAGCTGATGAGATTAAGAGGCATCCTCTATCCATTATATGTTCTAACATATCACCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776790.1
MSNKENAVAAPIRGELSAEQRTRISQNFRAAKARLSRKRPISDLTAASDGLSSILTYGDERKTKCTVVADEIKRHPLSIICSNISPPIALKGEYLSEKSDGARNGFSCETLLTPVVEAECSERVAPSDAYSSKIDSNGEGFDVQKVGLSLKDGSILSPVCTPLRQQDRSYECNSSSESNLIRALALPDTSVCVSTSHLLDDDFDESILEQIDALCEQILSDNPQRKDCAMERLETEFVIKSCKGDISTTDVKVTSEILKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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