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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001820`

染色体: Chr07 坐标: 15677502-15680832 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001820`
名称	SmilChr07G001820
描述	BTB/POZ domain-containing protein At1g67900
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	15677502 - 15680832 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995506`
GeneID	`130995506`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995506`
原始查询	`SmilChr07G001820`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ domain-containing protein At1g67900
产物	BTB/POZ domain-containing protein At1g67900
Arabidopsis	`AT1G67900` (AT1G67900) Phototropic-responsive NPH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843118] identity=67.6; qcov=1.07; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0477000` - identity=44.2; qcov=1.09; evalue=6.8e-176; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03000 (NPH3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995506

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776793.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057776793.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057776793.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776793.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776793.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:15677743`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B44,C15,C17,C21
`Chr7:15677743`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B44,C15,C17,C21
`Chr7:15677938`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	40	A1,A22,A5,B100,B108,B110,B115,B127,B13,B131,B134,B21,B41,B47,B52,B61,B65,B66,B7,B74,B77,B90,B91,B98,C11,C12,C13,C19,C21,C24,C26,C31,C34,C42,C46,C55,C59,C69,C9,D10
`Chr7:15677939`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D4
`Chr7:15677939`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D4
`Chr7:15678269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:15678381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B131
`Chr7:15678474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B77,B78,C34,C56
`Chr7:15678580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr7:15678985`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	56	A18,A19,A23,A24,A6,A7,A8,B105,B11,B114,B123,B129,B132,B134,B138,B140,B15,B17,B20,B26,B31,B35,B45,B49,B51,B52,B54,B55,B64,B78,B82,B86,B93,B98,C10,C23,C27,C30,C35,C37,C38,C40,C41,C43,C44,C49,C51,C55,C65,C72,C76,C80,C81,C82,D5,D9
`Chr7:15678986`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	56	A18,A19,A23,A24,A6,A7,A8,B105,B11,B114,B123,B129,B132,B134,B138,B140,B15,B17,B20,B26,B31,B35,B45,B49,B51,B52,B54,B55,B64,B78,B82,B86,B93,B98,C10,C23,C27,C30,C35,C37,C38,C40,C41,C43,C44,C49,C51,C55,C65,C72,C76,C80,C81,C82,D5,D9
`Chr7:15679111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776793.1

595 aa

298

595

NPH3

PF03000 NPH3 210-485 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776793.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	210	485	6.6e-93	311.8	NPH3 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920810.1
GTCGGTATGCCACAACAGTTGCAGTCTCAAAAATCAGTGTAGTGATAGTGAGACACAAATCATATTCCTCTTTTAATCATCTCTCCATCTTTTTTTTCTCGCCCTAAACTCGAAGATTTATAATTATCCCATATTTTATTCTACAAACAGAGCGGCGTAGGATGGTGGTTATAAAGCAGTAGTGGGCTAAAGTAATCCGGGTTTATTGAGGAAACAACAGTAGTGGTAATGAAAATTGGAGTGGCAATGATGAGGGAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995506
ATGAAGTTTATGAAACTCGGATCTCGCCCTGATACTTTCTACACAACAGAATCCACTAGGTGTGTATCATCTGAAGTGTCGAGCGATCTCATCGTGCAAGTAAAGGGAACCAGATACTTACTGCATAAGTTTCCCCTGCTGTCCAAGTGCCTTCGTCTGCAGAGGCTATGCGCGGAGAGCCCCGAGGCTCTGCAGGTGCAGATAGTGCAGCTTCCCGACTTCCCCGGCGGCGTGGAGGCCTTTGATCTCTGCGCCAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776793.1
MKFMKLGSRPDTFYTTESTRCVSSEVSSDLIVQVKGTRYLLHKFPLLSKCLRLQRLCAESPEALQVQIVQLPDFPGGVEAFDLCAKFCYGITVTLSAYNIVAVRCAAEYLQMTEDVEKGNLIYKIDVFLNSCILHGWRDSIVTLQSTKAFPMWSEDLGITSRCIEAIAAKVVSHPTKAALSHSCSRRGRDDASCNGSESQRHKSVSRGGWWAEDLAELGIDLYWRTMIAIKSGGKLPASLVGEALRVYASRWLPNVSKYI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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