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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001822`

染色体: Chr07 坐标: 15718989-15722966 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001822`
名称	SmilChr07G001822
描述	uncharacterized SmilChr07G001822
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	15718989 - 15722966 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993882`
GeneID	`130993882`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993882`
原始查询	`SmilChr07G001822`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=24.7; qcov=0.446; evalue=6.85e-29; confidence=weak
Rice	`Os06g0484800` - identity=26.5; qcov=0.862; evalue=3.44e-72; confidence=low
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF03372 (Exo_endo_phos); PF14529 (Exo_endo_phos_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993882

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774901.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057774901.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057774901.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774901.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774901.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:15720585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr7:15721260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A13,A14,B36,B48,C12,C50,C54,C86,D1
`Chr7:15721625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B80,C75
`Chr7:15721643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B112,B2,B99
`Chr7:15721643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B2,B99
`Chr7:15721660`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C46
`Chr7:15721660`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C46
`Chr7:15721662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B2,B99
`Chr7:15721663`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C46
`Chr7:15721663`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C46
`Chr7:15722783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B20
`Chr7:15722882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774901.1

909 aa

454

909

Exo_endo_phos

Exo_endo_phos_2

RVT_1

PF03372 Exo_endo_phos 24-189 aa PF14529 Exo_endo_phos_2 67-192 aa PF00078 RVT_1 462-654 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774901.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	24	189	6.1e-06	26.9	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family
`XP_057774901.1`	Pfam	`PF14529`	Exo_endo_phos_2	Domain	67	192	9e-08	32.7	Endonuclease-reverse transcriptase
`XP_057774901.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	462	654	3.9e-22	79.8	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918918.1
ATGGAGACTTTTAGTGATGTTTTTGGTAATTCTTGGTGGGGGTTTAATAACACAGATAAGGCAATCAGGAACTCTGAGGGGAGAGCTGGGGGAATTGTGTGTTTATGGAATAGGGAGGTGTTCGAAGCATCTAGTTCTTGGGATTTACCGGGGGCCGTGGTTGTTAACGGTAGGTACAAGAAGGACGGTCTATTGTGTTGCATTATCAATGTTTATGCGCCAACTGAATCAAAGGAAAAGAGGATTCTCTGGGATGCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993882
ATGGAGACTTTTAGTGATGTTTTTGGTAATTCTTGGTGGGGGTTTAATAACACAGATAAGGCAATCAGGAACTCTGAGGGGAGAGCTGGGGGAATTGTGTGTTTATGGAATAGGGAGGTGTTCGAAGCATCTAGTTCTTGGGATTTACCGGGGGCCGTGGTTGTTAACGGTAGGTACAAGAAGGACGGTCTATTGTGTTGCATTATCAATGTTTATGCGCCAACTGAATCAAAGGAAAAGAGGATTCTCTGGGATGCAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774901.1
METFSDVFGNSWWGFNNTDKAIRNSEGRAGGIVCLWNREVFEASSSWDLPGAVVVNGRYKKDGLLCCIINVYAPTESKEKRILWDAIGSIVEQNADRSVCILGDFNAVRRREERVGSGETFRASDARFFEDFIRGNDLKEIHTQGRKYTWYKPNGKCKSKIDRFLVNETWMLTWEGSSARGLQRSISDHCPIVLTTRTEDWGPRPFRFLNAWTNHPEFEDVVKKVWTGTDCQGWSFFVVKEKLKKLREALKVWNRTSFGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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