当前解析结果
SmilChr07G001823| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001823 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001823 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001823 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 15729155 - 15730848 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130995509 |
|---|---|
| GeneID | 130995509 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995509 |
| 原始查询 | SmilChr07G001823 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995509 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057776797.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057776797.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057776797.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057776797.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057776797.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:15729316 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B28 |
Chr7:15729433 |
GAT |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 77 | A10,A23,A25,A5,B100,B111,B114,B118,B121,B125,B127,B128,B129,B130,B133,B134,B138,B18,B22,B23,B25,B26,B27,B29,B3,B31,B33,B44,B47,B50,B53,B60,B61,B64,B65,B69,B70,B73,B75,B8,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B99,C14,C15,C18,C19,C21,C24,C25,C29,C3,C31,C36,C39,C40,C44,C45,C52,C54,C55,C57,C58,C6,C62,C64,C66,C73,C85,C9,D5,D6,D8 |
Chr7:15729580 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B121,B128,C5 |
Chr7:15729601 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C39 |
Chr7:15729601 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。