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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001830`

染色体: Chr07 坐标: 15784298-15792016 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001830`
名称	SmilChr07G001830
描述	coilin
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	15784298 - 15792016 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995517`
GeneID	`130995517`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995517`
原始查询	`SmilChr07G001830`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	coilin
产物	coilin
Arabidopsis	`AT1G13030` (AT1G13030) sphere organelles protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837860] identity=40.4; qcov=0.426; evalue=1.15e-58; confidence=low
Rice	`Os12g0288600` - identity=33.5; qcov=0.491; evalue=7.33e-47; confidence=low
GO	GO:0000387 (spliceosomal snRNP assembly); GO:0015030 (Cajal body); GO:0030619 (U1 snRNA binding); GO:0030620 (U2 snRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF15862 (Coilin_N); PF23086 (Tudor_Coilin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995517

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776809.1`
2	Nucleolus	核仁	0.60000	`XP_057776809.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776809.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776809.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776809.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:15784609`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A24,B138,C33,C59
`Chr7:15784609`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A24,B138,C33,C59
`Chr7:15784613`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	43	A1,A16,A3,A4,B103,B109,B113,B127,B132,B133,B134,B36,B43,B45,B68,B85,B89,B93,B95,B96,B97,C1,C13,C17,C18,C20,C22,C27,C41,C42,C5,C55,C6,C60,C61,C64,C66,C73,C79,C86,C9,D4,D8
`Chr7:15785637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr7:15785691`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	53	A20,A25,A6,A7,B101,B105,B112,B115,B12,B121,B127,B129,B13,B130,B131,B133,B137,B14,B17,B2,B21,B34,B4,B44,B52,B54,B65,B72,B78,B81,B89,B95,C1,C10,C16,C19,C20,C22,C23,C29,C30,C33,C47,C52,C59,C70,C73,C81,C87,C9,D1,D11,D5
`Chr7:15785832`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B140
`Chr7:15785832`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B140
`Chr7:15785954`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B131,C37
`Chr7:15785954`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B131,C37
`Chr7:15785982`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B1,B109,B42,B45,B77
`Chr7:15785982`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B1,B109,B42,B45,B77
`Chr7:15785984`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B121,B81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776809.1

814 aa

407

814

Coilin_N

Tudor_Coilin

PF15862 Coilin_N 6-200 aa PF23086 Tudor_Coilin 551-652 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776809.1`	Pfam	`PF15862`	Coilin_N	Family	6	200	4.1e-13	50.1	Coilin N-terminus
`XP_057776809.1`	Pfam	`PF23086`	Tudor_Coilin	Domain	551	652	2.5e-45	153.7	Coilin, C-terminal Tudor domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920826.1
CATAACCTTAGTTTGGGGCATTAACCCCCTATCCTTATGCCAACACACACACAAGAAGCCTTCTAACTTTACTAACCTATTGTGTGGCATAAGCATTAAGCACTGAGTGAGTCTCCGTTTAATTACAGTGACACACACACTCCCAGCTCTCTCTCTATCTCTCCCTTCGCAGCGAACGGCAGTGTGCGAGAATTTGGGGATTCTTGCATGAGCGATGGACTTGGGCAAGAGAATCCGAGTGGTATTTAAGGATGACGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995517
ATGGACTTGGGCAAGAGAATCCGAGTGGTATTTAAGGATGACGACATTTTGAGCGAGACCCAGAAATTGGAGGGCTTCAGCCGCAGCTGGGTTCTGCTGGAACCCCCCCGCCACGACGCCGTTTCCGACCTCGCCTCCCATCTGCTCCACGCTTTTCAACTCCACCAATCCTGCCCCCACGGTCTCCTCCTCTCCATATCTGGCTTTGTCTTACCTCCGTTTGTATCTACCAGCATTTTAAAAGATAATGAAATTATCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776809.1
MDLGKRIRVVFKDDDILSETQKLEGFSRSWVLLEPPRHDAVSDLASHLLHAFQLHQSCPHGLLLSISGFVLPPFVSTSILKDNEIISVRKRKDILSIEGNKAANDVQKLKALEKRPVDGGVLLLANEEFEKEKGGYESDEEFEDDDEVPLEVVENSSGRNSNKKNRKRKVAESKDDDEVLLDVNEDSSGGHSRKKNRKRKAAEMLEGNKDKKHRSVVTGNGSSDVCKEKKDVAVAGNNVKNKDEPAKHSDKKDVEEPGEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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