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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001844`

染色体: Chr07 坐标: 15926847-15930022 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001844`
名称	SmilChr07G001844
描述	protein terminal ear1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	15926847 - 15930022 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995527`
GeneID	`130995527`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995527`
原始查询	`SmilChr07G001844`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein terminal ear1-like
产物	protein terminal ear1-like
Arabidopsis	`AT3G26120` (TEL1) terminal EAR1-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822211] identity=48.6; qcov=0.895; evalue=4.81e-153; confidence=high
Rice	`Os01g0907900` (PLA2) - identity=76.5; qcov=0.25; evalue=1.24e-78; confidence=weak
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF04059 (RRM_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995527

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776827.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057776827.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776827.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776827.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776827.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:15927216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,D10
`Chr7:15927250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B131,B56,B96,C72
`Chr7:15927286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,D10
`Chr7:15927336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:15927409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:15927448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr7:15927924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr7:15928218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B28,B55,C84,D7
`Chr7:15928232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr7:15928269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr7:15928564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr7:15929294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B20,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776827.1

611 aa

306

611

RRM_1

RRM_2

PF00076 RRM_1 195-258 aa PF04059 RRM_2 412-522 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776827.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	195	258	4.8e-13	49.5	RNA recognition motif
`XP_057776827.1`	Pfam	`PF04059`	RRM_2	Family	412	522	6.7e-35	119.9	RNA recognition motif 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920844.1
TCACTACTCACTACCTCTACCTCTACCATTCTCGTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTCTCTCACACACACAACATACAGATTACAGAGACACTAGTCCTCTACTATTCATAGGCCGAAGATTCAAGTAGAGCCTAGAGAGAGAAACAGATTGTGGTCGTACAGTACAGCCAAAGAATGAAAGAAAGTCTAGAGAGAGAAAGGAAGAAGCAAGAGATATGTACTGAAACGAAATATAACAAGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995527
ATGACCGATCCCGGTTTCCCTCTGATGCCGGTTCGCCACCTCGACCCCGCCGCTGAGGAGTTCTTCCCCAACGCCTCACCCCAAATTTACTACACCTACCCACCGTCGCCGGTCTACGACAGCATGGTGTACCCACGGCCGCCACACTTCCCTCCGTACGCGATAGAGCCCCCTCCGCCGCTTCCGGTCTCCGTCCCTCCGCCGTCGCCCACGCCCTCCCGGACGCTGCTCCTCAGCATGGTGCCGGCCTCCGTGAGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776827.1
MTDPGFPLMPVRHLDPAAEEFFPNASPQIYYTYPPSPVYDSMVYPRPPHFPPYAIEPPPPLPVSVPPPSPTPSRTLLLSMVPASVSESTVRRELEVFGDVRSVQMERRREGLVTVHFYDVRASQAALVAIQDQHMQQQFRLGRHYEAVLASPMMAVAPPLPPQSAVGLISGRVVWAQFVTPVTSGLPDGNNQGTLVIFNLRPGFSASYLKSIFEEFGPVKELRETPHKRSQRFVELYDVRDSAKAMAALNATQILGKNAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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