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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001878`

染色体: Chr07 坐标: 16249440-16252270 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001878`
名称	SmilChr07G001878
描述	uncharacterized SmilChr07G001878
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16249440 - 16252270 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995566`
GeneID	`130995566`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995566`
原始查询	`SmilChr07G001878`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Restriction endonuclease, type II-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843091]; symbol=AT1G67660; hit=AT1G67660; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Restriction endonuclease, type II-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843091]; symbol=AT1G67660; hit=AT1G67660; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G67660` (AT1G67660) Restriction endonuclease, type II-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843091] identity=59.7; qcov=1; evalue=9.39e-130; confidence=high
Rice	`Os08g0236700` - identity=66.9; qcov=0.822; evalue=1.18e-128; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09588 (YqaJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995566

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057776877.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057776877.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776877.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776877.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776877.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16250391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:16250548`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C19
`Chr7:16250548`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C19
`Chr7:16250549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr7:16250742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B37,C5
`Chr7:16251087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776877.1

309 aa

154

309

YqaJ

PF09588 YqaJ 71-210 aa

XP_057776878.1

309 aa

154

309

YqaJ

PF09588 YqaJ 71-210 aa

XP_057776879.1

309 aa

154

309

YqaJ

PF09588 YqaJ 71-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776877.1`	Pfam	`PF09588`	YqaJ	Domain	71	210	3.4e-23	83.3	YqaJ-like viral recombinase domain
`XP_057776878.1`	Pfam	`PF09588`	YqaJ	Domain	71	210	3.4e-23	83.3	YqaJ-like viral recombinase domain
`XP_057776879.1`	Pfam	`PF09588`	YqaJ	Domain	71	210	3.4e-23	83.3	YqaJ-like viral recombinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920894.1
AAAAGAGAAAAAAATCTGTAGTTTTTTTTTTTAATAAAAGAAAAAAATCTATAGTTAAACACTCTTTCTTCCTCCTTCTGCATATCCCCCCCTCCCATGCCCAACCTTCTTTCAATTCTTTTAGGTAAAGAAGTAACACACACACACACACATCCAGACAATCTTTACCCATTTCCTGCTAGTGTTTTGGTGGGTTTCTTTCATCTGAGTAAACTTCTCGTTTCTTCTCTACGTTGGTAGGTCATAGGTGGTAGCCAAAC...

XM_057920896.1
TTTTTTAATAAAAGAAAAAAATCTATAGTTAAACACTCTTTCTTCCTCCTTCTGCATATCCCCCCCTCCCATGCCCAACCTTCTTTCAATTCTTTTAGGTAAAGAAGTAACACACACACACACACATCCAGACAATCTTTACCCATTTCCTGCTAGTGTTTTGGTGGGTTTCTTTCATCTGAGTAAACTTCTCGTTTCTTCTCTACGTTGGTAGGTCATAGGTGGTAGCCAAACTATGACAAATGCCTCTGTTGCTAGAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130995566
ATGACAAATGCCTCTGTTGCTAGATTCAGTGGAATTAACAGAGCAGTGTTGCCACTTCCTCGTAGAAGAAAGTTCCGAATAGATTTTACAAGAAGCTTTTCAACCTGTGCTTCACCATTTGTGTGTTCATCTTCGTATGCCGTTTATCCCCCTTCTGCTTTTGTGTTGAACGCCCAACTCGCAGCATCAGATACCCTGCAACGCTCTGAAGAATGGTTTGCGCTACGCAGGGACAAGCTAACGACTAGTACCTTCAGCAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057776877.1
MTNASVARFSGINRAVLPLPRRRKFRIDFTRSFSTCASPFVCSSSYAVYPPSAFVLNAQLAASDTLQRSEEWFALRRDKLTTSTFSTALGMWKGKRRFELWQEKVFPSNVQVAEGSKKGAMEWGVLNEAAAIERYKSITGRDVSSLGFAIHSEDRLDWIGASPDGLLGCFQEGGILEVKCPFNKGKPETMLPWKTVPFYYMPQIQGQMEVIDRDWADLYCWTPNGSTIFRVYRERGYWQLIHGVLREFWWENVIPAREAL...

XP_057776878.1
MTNASVARFSGINRAVLPLPRRRKFRIDFTRSFSTCASPFVCSSSYAVYPPSAFVLNAQLAASDTLQRSEEWFALRRDKLTTSTFSTALGMWKGKRRFELWQEKVFPSNVQVAEGSKKGAMEWGVLNEAAAIERYKSITGRDVSSLGFAIHSEDRLDWIGASPDGLLGCFQEGGILEVKCPFNKGKPETMLPWKTVPFYYMPQIQGQMEVIDRDWADLYCWTPNGSTIFRVYRERGYWQLIHGVLREFWWENVIPAREAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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