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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001892`

染色体: Chr07 坐标: 16343135-16345754 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001892`
名称	SmilChr07G001892
描述	lysine histidine transporter 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16343135 - 16345754 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995578`
GeneID	`130995578`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995578`
原始查询	`SmilChr07G001892`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysine histidine transporter 1-like
产物	lysine histidine transporter 1-like
Arabidopsis	`AT5G40780` (LHT1) lysine histidine transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834078] identity=72.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0127100` (OsHT) - identity=72.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans); PF03222 (Trp_Tyr_perm)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995578

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057776907.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776907.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776907.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776907.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776907.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16343458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr7:16343945`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	90	A13,A14,A16,A18,A19,A20,A21,A23,A25,A3,A5,A7,A8,B1,B103,B104,B109,B11,B118,B120,B121,B126,B128,B13,B136,B17,B19,B20,B24,B26,B29,B3,B31,B32,B33,B38,B39,B4,B45,B54,B55,B57,B64,B65,B71,B72,B78,B79,B8,B80,B84,B85,B87,B93,B97,C1,C14,C16,C20,C24,C30,C35,C36,C37,C39,C42,C44,C46,C47,C51,C52,C55,C59,C60,C61,C62,C66,C74,C76,C78,C8,C80,C83,C85,C87,D10,D11,D6,D7,D8
`Chr7:16343955`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	61	A14,A16,A18,A19,A3,A5,A7,A8,B1,B104,B109,B11,B128,B13,B136,B17,B19,B20,B24,B26,B3,B31,B32,B38,B39,B4,B45,B54,B57,B64,B78,B79,B8,B84,B85,B87,B97,C1,C14,C20,C30,C35,C37,C39,C42,C46,C51,C52,C55,C59,C62,C66,C74,C76,C78,C8,C80,C85,C87,D11,D6
`Chr7:16343967`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	49	A14,A16,A18,A19,A3,A7,A8,B1,B104,B11,B13,B17,B20,B24,B26,B3,B32,B38,B39,B45,B54,B57,B78,B79,B8,B84,B85,B87,B97,C1,C14,C26,C30,C35,C37,C39,C46,C51,C55,C62,C66,C74,C76,C78,C8,C80,C85,D11,D6
`Chr7:16343968`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A5,B109,B128,B133,B136,B19,B64,C42,C52,C55,C59,C8,C87
`Chr7:16344007`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	50	A14,A15,A16,A20,A21,A23,A25,A3,B104,B105,B109,B11,B125,B126,B136,B17,B2,B20,B3,B32,B33,B38,B39,B54,B57,B72,B84,B85,B95,C1,C10,C14,C2,C20,C28,C36,C4,C44,C46,C47,C50,C62,C66,C73,C76,C78,C8,C80,D10,D6
`Chr7:16344017`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A15,B105,B125,C2,C36,C50
`Chr7:16344018`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	38	A14,A16,A20,A21,A23,A25,A3,B104,B11,B126,B136,B17,B2,B20,B3,B32,B54,B57,B72,B84,B95,C1,C10,C14,C28,C44,C46,C47,C61,C62,C66,C73,C76,C78,C8,C80,D10,D6
`Chr7:16344021`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	36	A14,A16,A20,A21,A23,A25,A3,B104,B11,B126,B136,B17,B2,B20,B3,B32,B54,B57,B72,B84,B95,C1,C10,C28,C44,C46,C47,C61,C62,C66,C73,C76,C78,C8,C80,D6
`Chr7:16344032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B105,B125,C2,C50
`Chr7:16344124`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A2,A8,B83,C44,C62,C78
`Chr7:16344427`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A18,B1,B10,B108,B11,B113,B120,B131,B23,B26,B5,B59,B65,B66,B90,B93,C40,C43,C50,C55,C56,C68,C74,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776907.1

432 aa

216

432

Aa_trans

Trp_Tyr_perm

PF01490 Aa_trans 25-416 aa PF03222 Trp_Tyr_perm 28-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776907.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	25	416	1.3e-108	364.1	Transmembrane amino acid transporter protein
`XP_057776907.1`	Pfam	`PF03222`	Trp_Tyr_perm	Family	28	185	4.5e-09	36.6	Tryptophan/tyrosine permease family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920924.1
CTCATCATTCTTGACGTTATATTTGTTGTCGGTTAATTTTGGTAACGGAGCGAATTTGGCACGCTTTTGATTCAACTTTCCAAACTCAAAAAGAATCAAAGACTGTTGACTAAATATTTCCTAAAATCTTGTGAGATTTTAATGGCTGGATTTGGAACTGCAAGCAACTTTCCTTGTATTCAGATATAATATATAGTAATACATAATGAAGTGATTGTTATTGAGACCAGAGCTAATTGTTCTTGTTTAGAGAGGATAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995578
ATGGCTGGCCGTGACGAGAGGACGGTGGAGGAGAAGGCGATCGACGACTGGCTTCCGATCACCTCGTCGAGGACGGCCAAATGGTGGTACTCAACTTTCCACAATGTGACTGCCATGGTTGGAGCTGGTGTCCTAAGTCTTCCATATGCCATGTCAAGCATGGGATGGGGAGCTGGTGTGACAATGATGGTAATCTCATGGATCATCACCCTCTACACACTATGGCAAATGGTGGAGATGCACGAGATGGTTCCGGGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776907.1
MAGRDERTVEEKAIDDWLPITSSRTAKWWYSTFHNVTAMVGAGVLSLPYAMSSMGWGAGVTMMVISWIITLYTLWQMVEMHEMVPGKRFDRYHELGQHAFGEKLGLYIVVPQQVVVEVSTCIIYMVTGGKSLKKTHESLCSDCKEIKLTYFILIFASVHFILSHLPNFNSISIVSLAAAVMSLTYSTIAWTAALAKGSDGHVDYGPRGENTKDNVFNFFNALGDIAFAYAGHNVVLEIQATIPSPSKKPMWKGVVFAYVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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