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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001893`

染色体: Chr07 坐标: 16346138-16347253 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001893`
名称	SmilChr07G001893
描述	TLC domain-containing protein At5g14285-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16346138 - 16347253 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995579`
GeneID	`130995579`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995579`
原始查询	`SmilChr07G001893`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TLC domain-containing protein At5g14285-like
产物	TLC domain-containing protein At5g14285-like
Arabidopsis	`AT5G14285` (AT5G14285) DNA-binding storekeeper [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721155] identity=50.2; qcov=0.954; evalue=2.59e-75; confidence=high
Rice	`Os05g0302600` - identity=43.8; qcov=1.05; evalue=6.56e-57; confidence=medium
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03798 (TRAM_LAG1_CLN8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995579

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057776908.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057776908.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057776908.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776908.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776908.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16346540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C61
`Chr7:16346885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr7:16346890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,A7,B32,B84,C16
`Chr7:16347008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C11,C13,C65,C69
`Chr7:16347010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,C33,C66,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776908.1

238 aa

119

238

TRAM_LAG1_CLN8

PF03798 TRAM_LAG1_CLN8 42-225 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776908.1`	Pfam	`PF03798`	TRAM_LAG1_CLN8	Domain	42	225	1.7e-13	51.7	TLC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920925.1
CATTTTTTAAATATTCTTTTTCCAATTTATTATTGAAGAACAATTACCCCCATACTAGAAAATCAATACATCATCAATCCAAATCCAAATCCAAATCCAAATCAAAATCTAAAACCAAAATCCTTATATACTTTTTACTTGAGACATAGACAAAACTGGATTTTATGATTCAAAACCTCCAAACAATTCTGTCTCTCTCTCTCTAACACTCCATTAATGGACATCCGAAAACCGGAGGATTCAGCCATCCTTCCATTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995579
ATGGACATCCGAAAACCGGAGGATTCAGCCATCCTTCCATTCACAGTATGGTTCATCTCCATATACATGGTGGGATACTTTATGAGCTTCAGAAAGTGGGGGAAAAAGCAGAGAGGCGAAGCATCGAGCTGTCTCATCTCCCTGGCTCACGGCACCCCCGCGCTAATCCTATCACTCCTATCCTCATCCCATCTGGACTTATCGTCGCCAAACACGGCCTTCCACAACCTAGTTCTGGACCACAGCATTGCCTATTTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776908.1
MDIRKPEDSAILPFTVWFISIYMVGYFMSFRKWGKKQRGEASSCLISLAHGTPALILSLLSSSHLDLSSPNTAFHNLVLDHSIAYFATDLLHYALLIPTDALFIAHHLATLYVLATCRFAFSHGAVAVLRILALAEVTSLCQNAWTLAGYRRRDSARATALFEFLSPLFYGFYSVVRGILGPLYVCKIGFFFVGSDEIPRWGWVSWIVVMVVGIGLSVFWVLHLWLDLYTRRVNHKKS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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