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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001894`

染色体: Chr07 坐标: 16350903-16355146 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001894`
名称	SmilChr07G001894
描述	3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase 4-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16350903 - 16355146 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995580`
GeneID	`130995580`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995580`
原始查询	`SmilChr07G001894`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase 4-like
产物	3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase 4-like
Arabidopsis	`AT1G24360` (AT1G24360) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839053] identity=67.3; qcov=1; evalue=7.83e-149; confidence=high
Rice	`Os02g0503500` - identity=74.4; qcov=0.896; evalue=8.47e-151; confidence=high
GO	GO:0004316 (3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADPH) activity); GO:0006633 (fatty acid biosynthetic process); GO:0051287 (NAD binding)
KEGG	smil00061 (Fatty acid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00780 (Biotin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01212 (Fatty acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995580

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057776909.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057776909.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776909.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776909.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776909.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16351469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B123,B134,B87
`Chr7:16351480`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B10,B126,B32,B57,B64,C1,C41,C43,C75
`Chr7:16352219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr7:16352287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C61
`Chr7:16352707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C12
`Chr7:16354652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C83
`Chr7:16354776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776909.1

318 aa

159

318

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 77-268 aa PF08659 KR 78-232 aa PF13561 adh_short_C2 82-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776909.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	77	268	6.1e-66	222.4	short chain dehydrogenase
`XP_057776909.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	78	232	1.5e-21	77.8	KR domain
`XP_057776909.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	82	316	2.4e-64	217.9	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920926.1
GAGTTTCTTTGGTCTTGTATTTGAGTTTGGTTTCACCCAAACTGCTTTGTCACTCTTCAATTGAATGAAAATATCATTTTTGCAAAAAAAAAAAGAAATAAAAATAGAAAAAAGACAAAGAAAAGGTTTAGAGTGGAAGACACAAAAACAATAGTAAATCTTAACCACCCAACCAAAATGGAGGAAATGAACATAGTAGTCATCGCCCCGCTCACGCCAACACTGCCTCTGCGGAATTTCCCAAGCTTTGCAAATATAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995580
ATGGCTGCTGCCTCTGCCGCTGGATCTGCCGTCCTTTCCCTCAATGCTGCCGGGATTTCTCACCGCAAACTCTCCAATTTTAGCCTGGTTTCATTGCCTGTTAAATTTCCGGCCTCCCTTGATTTGCAATGCCGATCTCTTCGCTCCGCTTCTTCCCCAGGCGCAAAGGCGCAGGTCGCGACTGTCGAACAAGCGGCTACTGAAACGCCACAGAAGGTAGAAGCTCCTGTTGTTGTTATCACTGGAGCTTCCAGAGGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776909.1
MAAASAAGSAVLSLNAAGISHRKLSNFSLVSLPVKFPASLDLQCRSLRSASSPGAKAQVATVEQAATETPQKVEAPVVVITGASRGIGKAVALALGKAGCKILVNYARSSSEAEEVCKEIEASGGQALTFGGDVSKEADVESMIKTAVDAWGTVDVLINNAGITRDGLLMRMKTSQWQEVIDLNLTGVFLCTQAAAKVMMRKKKGRIINISSVVGLVGNVGQANYSAAKAGVIGLTKTVAKEYSSRNITVNAVAPGFIAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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