当前解析结果
SmilChr07G001900| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001900 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001900 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001900 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 16414284 - 16417336 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130995586 |
|---|---|
| GeneID | 130995586 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995586 |
| 原始查询 | SmilChr07G001900 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839051]; symbol=AT1G24350; hit=AT1G24350; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839051]; symbol=AT1G24350; hit=AT1G24350; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G24350 (AT1G24350)Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839051] identity=76; qcov=0.869; evalue=1.93e-75; confidence=high |
| Rice | Os01g0901800 (P0035F12.32-2)- identity=74.3; qcov=0.833; evalue=2.1e-74; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02681 (DUF212) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995586 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057776924.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057776924.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 0.60000 | XP_057776924.1 |
| 4 | Mitochondrion outer membrane | 线粒体外膜 | 0.20000 | XP_057776924.1 |
| 5 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057776924.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:16414570 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:16417086 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B23 |
Chr7:16417090 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B67,C65 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057776924.1PF02681
DUF212 27-160 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057776924.1 |
Pfam | PF02681 |
DUF212 | Family | 27 | 160 | 6.9e-49 | 166.0 | Divergent PAP2 family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。